菏澤市戲劇院棗梆劇團的前身是冀魯豫二專區民生劇社，始建於1947年11月。1950年移交平原省菏澤專署領導，改名為"菏澤專署人民劇社二組"。1959年，菏澤、濟寧兩專區重新分劃後，定名為"菏澤專區棗梆劇團"。1960年，以專區棗梆劇團為主，吸納鄆城縣文娛劇社、梁山縣晨光四團兩個棗梆專業團體的部分演職員，組成"菏澤地方戲曲院棗梆劇團"。2001年，菏澤市棗梆劇團歸屬市戲劇院，更名為菏澤市戲劇院棗梆劇團。
棗梆劇團曾多次參加國家、省、市戲曲匯演。1954年，傳統劇目《徐龍鍘子》、《狄青借衣》參加山東省第一屆戲曲觀摩演出大會，梁保興獲演員獎，趙鳳來獲獎狀。1956年，傳統劇目《無底洞》參加山東省第二屆戲曲觀摩演出大會，王聖樂獲演員二等獎，李金英獲演員三等獎。1964年，創作演出的大型現代戲《牡丹向陽開》，參加山東省地方戲曲革命現代戲觀摩演出大會，並在濟南南郊賓館為賀龍、羅瑞卿、彭紹輝、劉亞樓、曾山等領導人演出。1986年，創作演出的古裝戲《漢陽案》，參加山東省第三屆戲劇演出月，獲劇本獎、作曲獎、伴奏獎、字幕獎等。 1992年，在文化部舉辦的“天下第一團”優秀劇目展演中，創作演出的現代戲《生兒容易養子難》獲劇目獎。1998年，創作演出的現代戲《走出大山》，在第六屆山東文化藝術節中，榮獲劇目二等獎。1999年，該劇目獲第五屆山東省“五個一”精品工程獎。2001年，創作排演的古裝戲《包公賣官》，參加第七屆山東文化藝術節，獲劇目二等獎。同年，在菏澤市首屆戲曲節演出的新編歷史劇《生死牌》獲演出一等獎。2004年，在菏澤市第二屆戲曲節演出的新編歷史劇《素蘭告狀》，獲劇目一等獎。
菏澤市戲劇院棗梆劇團各個時期都湧現了許多在藝術上頗有造詣、在民眾中頗有聲望的優秀演員，如樊自瑞（紅臉，藝名“大雞”）、樊欣賢（紅臉，藝名“樊三”）、王新鼎（黑臉，藝名“大金鴿”）、梅新賀（小生，藝名“小明”）、劉富貴（小生，藝名“如意”）、邢德穩（小生，藝名“連眾”）、桂相連（旦，藝名“狗旦”）、於恆久（旦，藝名“五輩”）、梁保興（黑臉）、趙鳳來（紅臉）、房靈鶴（紅臉）、樊秀玲（旦）、周玉環（老旦）、張文英（小生）、張新讓（醜）、黃廣義（紅臉）等。近年來，一批年輕的優秀演員又脫穎而出，成為劇團的主要演員和業務骨幹，如王福俊、扈慶茹、劉長安等。
