南少林寺位於莆田荔城區西天尾鎮九蓮山林山村,距市區約17公里。南少林寺前身名“林泉寺”,建於南朝永定年間(公元577年),唐初因十三棍僧救唐主有功,太宗皇帝特敕北少林曇宗方丈,在南方建少林寺,稱為南少林寺。
1986年考古學家挖掘發現南少林寺遺址;1992年福建省政府正式批准莆田市政府在遺址上重建南少林寺;1998年莆田南少林寺重建竣工;2006年南少林寺恢復宗教活動,莆田市政府禮請時任中國佛教協會駐會副會長的學誠大和尚主持寺院工作;2012年12月29日南少林寺舉行了盛大了升座儀式,空性法師榮膺南少林寺方丈,學誠大和尚為空性法師送座。
2018年10月28日上午九點,參加第五屆世界佛教論壇的海內外高僧大德及各位嘉賓來到莆田南少林寺參觀。