《芍藥科基於基因組學的系統發育和進化研究》是洪德元為項目負責人，中國科學院植物研究所為依託單位的重點項目。
基本介紹
- 中文名：芍藥科基於基因組學的系統發育和進化研究
- 項目類別 ：重點項目
- 項目負責人：洪德元
- 依託單位 ：中國科學院植物研究所
科研成果,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | 被子植物葉綠體基因組的結構變異研究進展 | 期刊論文 | 王玲，董文攀，*周世良| |
2 | Nuclear and chloroplast SSR markers in Paeonia delavayi (Paeoniaceae) and cross-species amplification in P. ludlowii | 期刊論文 | Zhang JM, Liu J, Sun HL, Yu J, Wang JX, *Zhou SL| |
3 | Highly variable chloroplast markers for evaluating plant phylogeny at low taxonomic levels and for DNA barcoding | 期刊論文 | (1) Dong W, Liu J, Yu J, Wang L, *Zhou S| |
4 | Genetic Structure of the tree peony (Paeonia rockii) and the Qinling Mountains as a geographic barrier driving the fragmentation of a large population | 期刊論文 | Yuan JH, *Cheng FY, *Zhou SL| |
5 | Complete chloroplast genome of Sedum sarmentosum and chloroplast genome evolution in Saxifragales | 期刊論文 | (2) Dong W, Xu C, Cheng T, *Zhou S| |
6 | A new status in tree peonies (Paeoniaceae) | 期刊論文 | Hong DY| |
7 | Sequencing angiosperm plastid genomes made easy: A complete set of universal primers and a case study on the phylogeny of Saxifragales | 期刊論文 | (3) Dong W, Xu C, Cheng T, Lin K, *Zhou S| |
項目摘要
芍藥科（只有芍藥屬，包括牡丹與芍藥）是著名花卉和藥用植物，吸引了學者的高度關注。芍藥科在被子植物中的系統位置顯得孤立。基於形態得出其近親為毛茛類、五椏果類等不同結論，依據數個基因片段的分子數據的結論則為虎耳草目、金虎尾目等。在屬內的系統發育研究方面，至今套用6個葉綠體基因和4個核基因片段構建的基因樹解析度不夠高、不同基因樹相衝突，未能深刻揭示芍藥科物種之間的系統發育關係。本項目擬（1）測定芍藥科及其相關類群的葉綠體和線粒體基因組全序列，分析這兩個基因組的進化規律，確定芍藥科的系統位置，探明其系統位置難決的原因；（2）測定芍藥科轉錄組，根據轉錄組序列篩選足夠量（約100個）的單拷貝或寡拷貝核基因，構建全部物種的高解析度分子樹，揭示物種之間的系統發育關係，探討物種形成的過程和機制，分析芍藥屬現代分布格局的成因；（3）在建立準確的物種關係的基礎上，追溯栽培牡丹的起源，揭示牡丹多姿多彩的成因。
