良種場苗圃生產成本核算指對苗圃樹苗成本的核算。苗圃的產品是樹苗。苗圃生產費用的匯集一般是從整地育苗開始，到起苗出售或移植時為止。應按樹種和播種年份分別設定明細分類帳進行成本核算。其生產費用，在樹苗起用前，作為在產品處理，起用後，作為種苗成本處理，對於起苗前的生產費用，在起苗年份按起用部分和未起用部分所占的面積和株數的比例分攤，（但要注意的是，苗圃一般是選擇質量好的苗木起用，為正確合理核算成本，可將苗圃的樹苗株數和面積折合計算）。起苗時的費用全部由起苗部分負擔。當年只有少量出售的，可按實際收入沖減苗圃生產成本。苗圃生產成本項目和果樹生產成本項目相同。專業良種場的苗圃生產費用以“良種生產”科目核算，非專業良種場的苗圃生產以“其他農副業生產”科目核算產品成本。
