舟山市防汛防旱防台指揮部辦公室是舟山市水利局直屬單位。
1、承擔市人民政府防汛防旱防台指揮部的日常工作；
2、組織、協調、監督、指導新區（全市）防汛防台抗旱工作，並向市防汛防旱防台指揮部提出重要防汛防台抗旱指揮、調度、決策意見；
3、組織編制市級防汛防台抗旱應急預案並監督實施，具體實施重要水庫的洪水調度方案，會同工程管理處審批市本級水庫和中型水庫控制運行計畫；
4、掌握雨情、水情和水利工程安全運行情況，編制和發布汛情、旱情、災情通告；
5、組織指導基層防汛防台體系建設，組織指導防汛防台抗旱制度建設、隊伍能力建設，指導、監督防洪搶險工作，檢查督促、聯絡協調有關部門、單位做好防汛防台抗旱工程設施和毀損工程的修復；
6、組織協調新區（全市）防汛防台抗旱指揮系統建設與運行管理，監督、指導新區（全市）防汛防台抗旱物資的儲備管理，負責協調新區（全市）防汛防台抗旱物資和隊伍的調用；
7、組織開展市防汛防台抗旱工作總結和評估；
8、指導水利突發公共事件的應急管理工作；
9、承辦市防汛防旱防台指揮部和局領導交辦的其他事項。
