《與生物序列結構、功能有關的數學方法研究》是依託大連理工大學,由王天明擔任醒目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:與生物序列結構、功能有關的數學方法研究
- 依託單位:大連理工大學
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:王天明
- 負責人職稱:教授
- 批准號:10871219
- 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
- 申請代碼:A0604
- 支持經費:23(萬元)
《與生物序列結構、功能有關的數學方法研究》是依託大連理工大學,由王天明擔任醒目負責人的面上項目。
《與生物序列結構、功能有關的數學方法研究》是依託大連理工大學,由王天明擔任醒目負責人的面上項目。項目摘要二十一世紀是生命科學的世紀,不斷積累的巨量的生物學數據和快速發展的信息學技術使得計算分子生物學逐漸發展成為一門獨立的...
使用EM算法處理具有高斯分布的有限混合因子分析模型中的非正態誤差等相關問題。 本項目研究對解析功能蛋白質的序列、結構、功能和進化之間的關係具有重要意義,完善和豐富了針對生物大分子序列數據建模的理論和方法。
術語“序列比對”也指構建上述比對或在潛在的不相關序列的資料庫中尋找significant alignments。背景及簡介 序列比對是生物信息學的基本組成和重要基礎。序列比對的基本思想是,基於生物學中序列決定結構,結構決定功能的普遍規律,將核酸序列和...
《生物計算 : 生物序列的分析方法與套用》是2010年科學出版社出版的圖書,作者是楊晶。內容簡介 該書介紹了生物計算中的幾種主要方法,如序列比對、系統發育分析、蛋白質序列的語義分析與結構預測、基因識別與生物晶片的數據分析等,並給...
本書介紹生物計算中的幾種主要方法,如序列比對、系統發育分析、蛋白質序列的語義分析與結構預測、基因識別與生物晶片的數據分析等,給出它們的基本問題與有關的方法及套用。全書由三部分組成。第一部分介紹這些問題的由來與主要內容,給出...
序列比對是生物序列分析的主要方法,也是生物信息學中挑戰性的問題之一。序列比對在序列裝配、序列注釋、基因和蛋白質的結構和功能預測以及系統發育和進化分析等方面均有廣泛套用,因此對它的研究一直以來都是熱點。進化算法是一類借鑑生物界...
生物數學是研究生物學中數量關係與空間結構的科學。生物數學通常分為兩部分。一部分是以數學方法研究生物問題而形成生物學新分支,稱為數學生物學,它包括數學生態學、數量遺傳學以及數量生理學等等。另一部分是以生物學中的數學問題而形成...
生物信息學也可以定義為對分子生物學中兩類信息流的研究:第一類信息流源於分子生物學的中心法則:DNA序列被轉錄為mRNA序列,後者被翻譯為蛋白質序列。蛋白質序列繼而摺疊為具功能的三維結構。按照達爾文演化理論,這些功能被生物體的環境所...
《生物序列分析》是2010年科學出版社出版的圖書,作者是Richard Durbin。內容簡介 《生物序列分析》在結構上大致可以分為四個部分,每個部分所覆蓋的問題分別是:二序列聯配、多序列聯配、系統發育樹和RNA結構,具體分為:二序列聯配、...
本項目分別在序列、結構和動態水平對自結合肽以及相關蛋白質/肽識別和相互作用開展系統的計算挖掘、信息分析和方法開拓,將自結合肽上升為一類新的生物分子識別現象、澄清其結構-功能關係並為後續相關研究打下基礎。主要內容包括:(1)提出...
由於生物學中的DNA的結構和生物現象與組合數學有密切的聯繫,各國對生物信息學的研究都很重視,這也是組合數學可以發揮作用的一個重要領域。由於DNA就是組合數學中的一個序列結構,美國科學院院士,近代組合數學的奠基人Rota教授預言,生物...
生物大分子,特別是蛋白質和核酸結構功能的研究,是分子生物學的基礎。現代化學和物理學理論、技術和方法的應 用推動了生物大分子結構功能的研究,從而出現了近30年來分子生物學的蓬勃發展。分子生物學和生物化學及生物物理學關係十分密切...
蛋白質的結構與功能密切相關,對蛋白質結構在進化過程中的特點進行分析和研究,從而建立起蛋白質結構進化的數學模型是本項目的主要研究內容。用機率統計以及資訊理論的方法,對蛋白質結構進行系統的分析,得到蛋白質結構進化的過程和規律,然後...
本項目將基於條件隨機場方法,研究單核苷酸多態性(SNP)晶片數據分析、蛋白質結構比較、生物分子網路的功能模組和通路研究三個重要的生物信息學問題。這三個問題分別代表了生物信息學中常見的三種數據類型:一維序列、三維結構和網路。針對這...
有效提取蛋白序列中胺基酸的相對分子量、等電點以及疏水性等信息,並初步套用於惡性腫瘤相關序列的相似性分析、蛋白質亞細胞定位預測、結構和功能靶標預測等熱點領域;利用序列的新型表達模式給出點突變分析方法,尋求產生點突變的數學機理。
蛋白質結構預測問題是生物信息學中最具有挑戰的問題之一。在生物系統自身比較複雜的背景下,建立有效的數學模型和尋找合理的最佳化算法成為生物信息學研究的一個核心內容。本項目主要解決在三維格線上胺基酸序列的摺疊問題。之前,學者們只是針對...
1.1定量構效關係研究概述 1.2肽定量構效關係研究進展 1.3蛋白質特性及功能預測研究進展 1.4本書主要研究內容及創新之處 2 統計建模方法與模型分析 2.1統計建模方法 2.2模型的評價 2.3模型套用域 3 胺基酸分子結構表征 3.1...
群體遺傳學的研究基礎是DNA序列變異。同源DNA序列的遺傳分化程度是衡量群體遺傳結構的主要指標, 其分化式樣則是理解群體遺傳結構產生和維持的進化內在驅動力諸如遺傳突變、重組、基因轉換的前提。隨著DNA測序越來越快捷便利及分子生物學技術的...
分子系統學是指通過對生物大分子(蛋白質、核酸等)的結構、功能等的進化研究,來闡明生物各類群(包括已絕滅的生物類群)間的譜系發生關係,相對於經典的形態系統分類研究,由於生物大分子本身就是遺傳信息的載體,含有龐大的信息量,且...