隨食物一起攝人的許多微牛物，被胃中的低 pH值所抑制或滅活。迸入消化道後，微生物的種類和數目隨pH的逐漸升高而增加。在大腸中，優勢菌一般是擬桿菌屬(Battervides),梭菌屬(Clostridium)。
特性
埃希氏菌屬 f.lischerich#a],乳桿菌屬(Lactobacillus)和鏈球菌屬(st帥tocact叫的細菌。還可能有產鹼菌屬(Altalt}enes),變形菌屬f Frnteus i和假單抱菌屬儼“-udamonns)的一些種。非細菌區系包括醉母〔如假絲酵母屬(Gandida)J和病毒(如從健康個體的糞便中分離到的某些腸變胞病毒)。 腸道微生物區系可以受飲食的影響。在哺人乳嬰兒中，微生物區系幾乎完全是兩歧雙歧桿菌(B必dvbra-cterium b嬌du叫.而在哺牛乳的嬰兒中，則為混合區系，包括嗜酸乳桿菌(Lactabacsllus acidophilru).大腸菌類和梭菌。服用抗生素後會引起腸道微生物區系的根本(暫時地)改變。
