胡家志(北京大學生命科學學院研究員)

胡家志(北京大學生命科學學院研究員)

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胡家志，研究員。教育經歷:2006.9-2012.7 博士 北京大學生命科學學院；2002.9-2006.7 學士 北京大學生命科學學院。工作經歷:2016.10 研究員 北京大學生命科學學院；2012.9-2016.9 博士後 哈佛大學醫學院及波士頓兒童醫院。

基本介紹

  • 中文名：胡家志
  • 任職院校：北京大學
  • 職稱：研究員
  • 畢業院校：北京大學
科研領域,代表論文,其它論文,

科研領域

免疫系統能有效清除感染病原，從而保護人類免受疾病的困擾。淋巴細胞受體（包含抗體和T細胞受體）是獲得性免疫的關鍵組分；獲得性免疫依賴淋巴細胞受體來識別抗原並進行病原的定向清除。淋巴細胞受體的產生具有高度多樣性的特點，而其識別抗原時又具有高度的特異性。淋巴細胞受體在疾病治療方面具有巨大的套用價值，但是淋巴細胞自身也存在基因組不穩定而轉化為腫瘤的可能。本實驗室的主要研究方向將集中在免疫基因組學與人類疾病，專注於研究淋巴細胞抗原受體產生的多樣性到抗原識別的特異性這一發育過程及該過程中的基因組穩定性維持機理，以及DNA代謝過程中淋巴細胞發生原癌性突變的分子基礎。免疫基因組學是隨著高通量測序技術的飛躍而發展起來的免疫學的一個重要分支，主要是藉助基因組學的方法來研究免疫學中關鍵生物過程。課題將劃分為：
1. 淋巴細胞受體（抗體和T細胞受體）多樣性產生的機理及調控機制，主要涉及到RAG蛋白的作用及調控機制；
2. 針對目的抗原產生高特異性的抗體並研究抗原-抗體作用規律，主要涉及到腫瘤浸潤性淋巴細胞的受體鑑定及其作用機制研究；
3. 淋巴細胞發育過程中基因組的穩定性維持機制及DNA修復過程，主要涉及到淋巴細胞V(D)J重排、抗體類型轉換、體細胞高頻突變及DNA複製和轉錄過程中基因組穩定性的維持及DNA雙鏈斷裂的修復機制；
4. 基因編輯過程中基因組的穩定性維持，主要是利用高通量測序的方法評估現有基因編輯工具酶在基因編輯過程中的基因組穩定性。

代表論文

  1. Zuo E#, Huo X#, Yao X#, Hu X#, Sun Y#, Yin J#, He B, Wang X, Shi L, Ping J, Wei Y, Ying W, Wei W, Liu W, Tang C, Li Y, Hu J* & Yang H*. (2017). CRISPR/Cas9-mediated targeted chromosome elimination. Genome Biology 18(1):224. doi: 10.1186/s13059-017-1354-4.
  2. Lin SG#, Ba Z#, Du Z#, Zhang Y, Hu J* & Alt FW*. (2016). A highly sensitive and unbiased approach for elucidating antibody repertoires. Proc Natl Acad Sci USA 113(28):7846-51. doi:10.1073/ pnas.1608649113.
  3. Hu J#, Meyers RM#, Dong J, Panchakshari RA, Alt FW* & Frock RL*. (2016). Detecting DNA double-stranded breaks in mammalian genomes by linear amplification-mediated high-throughput genome-wide translocation sequencing. Nature Protocols 11(5): 853-71. doi: 10.1038/nprot.2016.043.
  4. Hu J#, Zhang Y#, Zhao L, Frock RL, Du Z, Meyers RM, Meng F-L, Schatz DG, & Alt FW. (2015). Chromosomal loop domains direct the recombination of antigen receptor genes. Cell 163(4): 947-59. doi: 10.1016/j.cell.2015.10.016.
  5. Frock RL#, Hu J#, & Alt FW. (2015). Mechanisms of recurrent chromosomal translocations. In book: Chromosomal Translocations and Genome Rearrangements in Cancer. Springer International Publishing, ISBN: 978-3-319-19983-2. doi: 10.1007/978-3-319-19983-2
  6. Frock RL#, Hu J#, Meyers RM, Ho Y-J, Kii E, & Alt FW. (2015). Genome-wide detection of DNA double-stranded breaks induced by engineered nucleases. Nature Biotechnology 33(2):179-86. doi: 10.1038/ nbt.3101.
  7. Hu J#, Tepsuporn S#, Meyers RM, Gostissa M*, & Alt FW*. (2014). Developmental propagation of V(D)J recombination-associated DNA breaks and translocations in mature B cells via dicentric chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA 111(28): 10269-74. doi: 10.1073/pnas.1410112111.
  8. Tepsuporn S#, Hu J#, Gostissa M*, & Alt FW*. (2014). Mechanisms that can promote peripheral B-cell lymphoma in ATM-deficient mice. Cancer Immunol. Res. 2(9): 857-66. doi: 10.1158/2326-6066. CIR-14-0090.
  9. Hu J, Sun L, Shen F, Chen Y, Hua Y, Liu Y, Zhang M, Hu Y, Wang Q, Xu W, Sun F, Ji J, Murray JM, Carr AM, & Kong D. (2012). The intra-S phase checkpoint pathway targets Dna2 to prevent stalled replication forks from reversing. Cell 149(6): 1221-32. doi: 10.1016/j.cell.2012.04.030.(# 共同一作, *共同通訊)

其它論文

  1. Guan L, He P, Yang F, Zhang Y, Hu Y, Ding J, Hua Y, Zhang Y, Ye Q, Hu J, Wang T, Jin C, Kong D. (2017). Sap1 is a replication initiation factor essential for the assembly of pre-replicative complex in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. J Biol Chem. 292(15):6056-6075. doi: 10.1074/jbc.M116.767806.
  2. Liu B, Hu J, Wang J, Kong D. (2017). Direct visualization of RNA-DNA primer removal from Okazaki Fragments provides support for flap cleavage and exonucleolytic pathways in eukaryotic cells. J Biol Chem. 292(15):6056-6075. doi: 10.1074/jbc.M116.758599.
  3. Zhao L#, Frock RL#, Du Z, Hu J, Cheng L, Krangel MS*, Alt FW*. (2016). Orientation-specific RAG activity in chromosomal loop domains contributes to Tcrd V(D)J recombination during T cell development. J Exp Med 213(9): 1921-36. doi: 10.1084/jem.20160670.
  4. Dong J#, Panchakshari RA#, Zhang T#, Zhang Y, Hu J, Volpi SA, Meyers RM, Ho Y-J, Du Z, Robbiani DF, Meng F-L, Gostissa M, Nussenzweig MC, Manis JP*, & Alt FW*. (2015). Orientation-specific joining of AID-initiated DNA breaks promotes antibody class switching. Nature 525(7567): 134-9. doi: 10.1038 /nature14970.
  5. Meng F-L#, Du Z#, Federation A#, Hu J, Wang Q, Kieffer-Kwon KR, Meyers RM, Amor C, Wasserman CR, Neuberg D, Casellas R, Nussenzweig MC, Bradner JE*, Liu XS, & Alt FW*. (2014). Convergent transcription at intragenic Super-Enhancers targets AID-initiated genomic instability. Cell 159(7): 1538-48. doi: 10.1016/j.cell. 2014.11.014.Z
(# 共同一作, *共同通訊)

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