《胃癌易感基因功能SNPs分析及其表遺傳調控機制》是依託東南大學，由沈孝兵擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：胃癌易感基因功能SNPs分析及其表遺傳調控機制
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：沈孝兵
- 依託單位：東南大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
本研究採用基因組學與毒理學相結合的方法，通過構建漢族人永生化胃黏膜上皮細胞及相應的外周血淋巴細胞庫，套用ALM-ASA法對胃癌相關易感基因啟動子與外顯子區域進行多位點SNPs分型；以外源性致癌物標準化誘導細胞後，檢測並比較相關酶基因的表達和酶活性水平變化；通過基因結構-功能相關性的生物信息學分析後篩檢出功能SNPs，獲取致癌物暴露的SNPs遺傳標記，進一步分析其表達表遺傳調控機制，探索胃癌相關易感基因及表遺傳調控差異表達譜，構建一組基於易感基因結構（基因型）――表達水平――表遺傳調控機制的胃癌遺傳易感標誌物。同時採用病例對照研究方法，開展胃癌環境流行病學與血清分子流行病學研究，從基因型、表達水平、表遺傳調控水平三方面著手，分析胃癌相關易感基因之間的互動作用及基因與環境危險因素的互動作用，驗證前述標誌物與胃癌發生的關聯性，最終構建漢族人群胃癌遺傳易感標記。
結題摘要
1. 採用叉生分析方法探討胃癌易感基因功能SNPs位點與環境影響因素之間的互動作用，結果提示：①消化系統疾病史、腫瘤家族史、喜食新鮮水果、精神壓抑與CYP2E1（rs8192775）在胃癌的發生中均存在顯著的互動作用（Pint＜0.05）；②消化系統疾病史與MTHFR（rs11121832）在胃癌的發生中存在顯著的互動作用（Pint＜0.05）；③消化系統疾病史、腫瘤家族史、三餐不定時、喜食新鮮水果與MTHFR（rs3753582）在胃癌的發生中均存在顯著的互動作用（Pint＜0.05），喜食新鮮水果可以降低胃癌的發生。 2. 運用ALM-ASA法對胃癌相關易感基因啟動子與外顯子區域進行多位點SNPs分型；通過對南京564例原發性胃癌研究,篩選出7項胃癌易感基因，分別為：CYP2E1野生型､NAT2M1突變型､NAT2M2突變型、NAT2表型突變型、MTHFR A1298C突變型、XRCC1194突變型、VDR TaqⅠ突變型等，同時這些基因之間存在互動作用，且表現為協同作用（OR＞1）。 3.通過多基因危險度評價這一新的模型可有效的評價胃癌多基因聯合作用的危險度，這將更好地用於對原發性胃癌易感人群進行篩選。 4. SOCS-1和RIZ1基因啟動子區異常甲基化可能具有腫瘤特異性，提示其與腫瘤發生髮展有一定的關聯，通過檢測SOCS-1和RIZ1基因甲基化狀態，對於胃癌易感人群的篩選及胃癌患者的早期診斷與治療具有一定的指導意義。 5. N-亞硝基二乙胺染毒劑量增加，細胞增殖率顯著下降（P＜0.05），CYP2E1在高劑量組中表達水平上調，MTHFR、XRCC1在高劑量組中表達顯著降低。 套用中華民族SNPs等多個資料庫，對胃癌易感基因CYP2E1、MTHFR、XRCC1的啟動子、外顯子、內含子區域進行多SNPs位點選擇，同時採用多重高溫連線酶檢測反應技術（iMLDR）對660個DNA樣本的16個SNP位點進行分型。通過基因結構-功能相關性的生物信息學分析後篩出功能SNPs，CYP2E1（rs8192775）、MTHFR（rs11121832、rs3753582）位點的基因型頻率、等位基因頻率分布在病例組和對照組中差異有統計學意義（P＜0.05），獲取了致癌物暴露的SNPs遺傳標記，得到了胃癌遺傳易感標誌物。
