《肝癌細胞系中NS5ATP9調控靶基因的篩選及驗證》是依託西安交通大學,由石磊擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:肝癌細胞系中NS5ATP9調控靶基因的篩選及驗證
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:石磊
- 依託單位:西安交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
C型肝炎病毒(HCV)可引起慢性肝炎、肝硬化及肝細胞肝癌,但其發病機制不清。我們前期實驗發現NS5ATP9是HCV非結構蛋白 5A(NS5A)的反式激活基因,可能與病毒性肝炎及肝癌的發生髮展有關,並對NS5ATP9啟動子和其上游調控基因進行了研究。本實驗擬通過染色質免疫共沉澱結合啟動子晶片(CHIP-on-chip)技術對肝癌細胞系中NS5ATP9下游調控靶基因進行篩選;採用RNA干擾技術下調NS5ATP9在肝癌細胞系中的表達,套用微陣列-比較基因組雜交(array-based Comparative Genomic Hybridization,aCGH晶片)技術篩選相關調控基因;並綜合兩次篩選結果,通過雙螢光素酶報告基因檢測系統對篩選出的基因進行驗證,旨在探討NS5ATP9的調控通路,為揭示其在肝臟疾病中的作用提供有益的線索。
結題摘要
NS5ATP9與腫瘤的發生、發展有關,但是對其在肝癌中的功能卻知之甚少。我們發現NS5ATP9在肝癌中高表達,定位於細胞核,可能是一個轉錄因子。我們採用aCGH晶片技術檢測到NS5ATP9表達情況不同時染色體基因拷貝數的變化情況,發現NS5ATP9的表達可以改變細胞的染色體穩定性,影響一些與癌症進展有關的基因。另外,NS5ATP9 mRNA 在肝癌患者的外周單個核細胞(PBMC)中表達也存在上調,並與患者的預後相關。通過以上研究,發現了NS5ATP9作為肝癌腫瘤標誌物可能性,為進一步了解NS5ATP9基因的功能和將其套用於臨床作為肝癌早期無創診斷標誌物提供有益的線索;並且通過構建NS5ATP9互動網路圖,對闡明其在肝癌中的作用機制提供有益的線索,為腫瘤基因治療提供新的靶點。