考納斯機場於1988年竣工,接替達留斯和吉列納斯機場成為考納斯新的主機場。1991年立陶宛獨立後,考納斯機場成為國際機場。1996年,加入國際機場協會(Airports Council International,簡稱ACI)。 2005年,歐盟撥款對考納斯機場的跑道燈光系統進行升級。升級後的機場成為瑞典、拉脫維亞、白俄羅斯等鄰國以及俄羅斯加里寧格勒州各機場在惡劣天氣情況下的備降機場。2007年10月17日,機場新航站樓建設工程開工,至2008年3月底完工,5月13日正式開放。新航站樓配備了現代化的安檢設備和邊防設施,滿足了立陶宛正式實施申根協定之後的對機場的要求。新航站樓設有12個登機手續辦理櫃檯和8個登機口,大幅提高處理能力,減少旅客等候時間。