細胞系STR鑑定

據統計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識，因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導致研究結論錯誤、結果不可重複、臨床細胞治療災難性後果……，這浪費大量時間、精力和金錢。

STR（Short Tandem Repeat，短串聯重複序列）基因位點由長度為3～7個鹼基對的短串連重複序列組成，這些重複序列廣泛存在於人類基因組中，可作為高度多態性標記，被稱為細胞的DNA指紋。STR已被廣泛套用於親子鑑定、個體識別、司法鑑定、交通事故鑑定、（造血幹細胞）移植治療後嵌合情況監測等領域。

STR基因座位上的等位基因可通過PCR（聚合酶鏈式反應）擴增區域內重複序列的拷貝數的不同來區分，在毛細管電泳分離之後可通過螢光檢測來識別，隨後通過一定的計算方法，即可根據所得的STR分型結果與專業的細胞STR資料庫比對從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。

基本介紹

• 中文名：細胞系STR鑑定
• 外文名：Cell Line Authentication by STR profiling
• 背景介紹：細胞系錯誤辨識或交叉污染
• 技術項目：人源細胞系鑑定
• 技術原理：STR（Short Tandem Repeat）
• 套用：生物醫學研究
• 資料庫：需要專業的細胞系STR資料庫

背景介紹

據統計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識，因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導致研究結論錯誤、結果不可重複、臨床細胞治療災難性後果……，這浪費大量時間、精力和金錢。

Everything was going along fine until they discovered their HeLa cell line expressed Y chromosome markers	Cell Biology. Fixing problems with cell lines.Science, 2014. 346(6216): p. 1452-3

因此近年NIH、ATCC、Nature和Science等對此多次發出呼籲，要求研究者對細胞進行鑑定，如2011年美國國家標準學會專門頒布了一份細胞STR鑑定國家標準；2014 年12 月、2015 年2 月Science 雜誌分別發表文章專題闡述細胞交叉污染和錯誤辨識嚴重性；2015年4月Nature通知：Nature旗下雜誌將從5月開始要求作者鑑定論文中所用細胞系；2015年6月有報導稱一科學家由於用錯細胞系，撤銷Nature論文……。STR基因分型已被ICLAC、ATCC等權威機構作為金標準套用於細胞鑑定，目前越來越多的雜誌要求在投稿時提供細胞STR分型數據。細胞系STR鑑定——及時發現您的細胞是否被交叉污染或錯誤辨識。

細胞系STR鑑定相關重量級報導

鑑定時間

1、發表文章或申請課題經費前；

2、使用細胞進行臨床治療（試驗）前；

3、準備凍存保種或已凍存多年的細胞；

4、一個涉及到細胞試驗項目開始/結束時；

5、新得到的細胞或實驗室培養5代以上的細胞；

6、細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大；

7、異體細胞移植後嵌合情況檢查。

期刊

• Nature;
  
• BioTechniques;
  
• Cancer Research;
  
• Cancer Discovery;
  
• Clinical Cancer Research;
  
• Molecular Cancer Research;
  
• Cancer Prevention Research;
  
• International Journal of Cancer;
  
• Molecular Cancer Therapeutics;
  
• Cell Biochemistry and Biophysics;
  
• Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;
  
• In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal;
  
• ......
  

常用的21個STR位點名稱：
D5S818	D13S317	D7S820	D16S539	VWA	TH01	TPOX	Amelogenin; （性別位點）
CSF1PO	D3S1358	Penta E	D2S441	D2S1338	Penta D	D10S1248
D19S433	D21S11	D18S51	D6S1043	D8S1179	D12S391	FGA