與原核細胞不同，真核細胞分化成各種各樣的細胞器，例如細胞核、線粒體、葉綠體、核糖體、高爾基體、內質網、液泡等。一個細胞被分為很多個這樣的細胞器，這種現象稱為細胞的區域化（compartmentation）。
