《紅樹林小單胞菌培養與非培養水平多樣性與地理分布》是依託武漢大學，由洪葵擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：紅樹林小單胞菌培養與非培養水平多樣性與地理分布
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：洪葵
- 依託單位：武漢大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
小單胞菌是藥用海洋放線菌研究的熱點，近幾年報導了許多新的屬、種及其新生物活性天然產物。本項目將採集我國紅樹林地區的土壤樣品，設計小單胞菌科特異引物，在非培養水平進行16S rRNA基因克隆文庫分析，在培養水平對小單胞菌科不同屬進行選擇性分離和快速鑑定，並套用統計軟體分析土壤樣品的理化變數與樣品中培養與非培養水平的小單胞菌科類群的關係，從而認識我國紅樹林小單胞菌科的類群、分布及與土壤理化變數的關係，為理性地收集紅樹林小單胞菌資源奠定基礎。
結題摘要
本項目採集了海南文昌、海南三亞、廣東湛江、廣西北海4個不同紅樹林區16個樣點的土壤樣品。設計了小單胞菌科特異引物，在非培養水平進行了16S rRNA基因克隆文庫分析，在培養水平對小單胞菌科不同屬進行選擇性分離和快速鑑定，並套用統計軟體分析土壤樣品的理化變數與樣品中培養與非培養水平的小單胞菌科類群的關係。結果表明紅樹林地區在非培養水平有10個屬，Micromonospora，Rugosimonospora，Plantactinospora和 Verrucosispora等4個屬在4個紅樹林地區均有分布。某一特定的紅樹林土壤樣品，只有少數 OTUs的豐度較高，大部分的基因型的豐度都很低，存在優勢種群，分類水平越低，地理分布越明顯。並且，紅樹林土壤中的小單孢菌種群與環境因子沒有相關性。培養方法分離獲得了300株小單胞菌，其中鑑定小單孢菌新種7個，小單孢菌科疣孢菌新種1個。並從一株小單孢菌科繼生菌新屬中獲得了抗病毒活性天然產物。
