1861年 美國內戰爆發後，任密蘇里州志願兵準將，12月18日在黑水河流域擊敗南部的斯特林·普萊斯將軍，俘虜了1300名南部士兵，1862年3月晉升少將，擔任密西西比河軍團司令，平定了密西西比河流域的暴亂，占領了密蘇里州的新馬德里和10號島，接著南下孟菲斯，受到亞伯拉罕·林肯總統的表彰，。7月被派到謝南多厄河谷指揮新成立的7萬人的維吉尼亞軍團，和麥克萊倫的波托馬克軍團一起作戰，他們兩人一個魯莽，一個謹慎，非常的不配合。防守華盛頓期間，他在馬爾納斯車站的補給倉庫被石牆托馬斯·傑克遜突襲，他立即回軍窮追不捨，正當他自信的抓住傑克森的部隊時，他認為正在和喬治·布林頓·麥克萊倫僵持的羅伯特·李將軍卻拋開了對手，突然出現在他的側後，向他發起兇猛的攻擊，這就是北軍慘敗的第二次馬納沙斯之役，他的部隊瓦解了，損失高達1.5萬人，9月5日他被解除職務，調任西北戰區司令官，1863年3月晉升正規軍少將，再對印第安人戰爭中他重新成為一個優秀的司令官，但再也沒能挽回名譽。總的來說，他的組織水平要比戰術水平高一些。
