基本介紹
- 中文名：系統生物學中多組學綜合資料庫
- 外文名：A plurality of groups of integrated database in systems biology
- 目的：建立國內首個OMICS數據存儲中心
- 子庫：水稻、家蠶基因組數據等
系統生物學中多組學綜合資料庫，以中國科學院北京基因組研究所自2003年以來在基因組學、轉錄組學領域上取得的科研成果為基礎，以公開發表的基因組學、轉錄組學數據為核心，以研究所自產的原始數據及二級分析結果為補充，從而形成的一個整合基因組、轉錄組的多組學綜合資料庫系統。通過對基因組和轉錄組相關數據信息的蒐集、整理和整合，旨在建立國內首個OMICS數據存儲中心，為醫學、作物學、發育學、遺傳學、計算學等相關學科領域的科研人員提供主要的數據存儲、下載和服務中心。
本資料庫已經建設或正在建設的子庫有：水稻基因組數據、家蠶基因組數據、家雞基因組數據、流感病毒基因組數據以及人類基因組多態性數據。其中水稻基因組數據收錄了兩個不同品種的數據即indica 9311和Syngenta japonica，同時，收錄了最新的scaffold、contig序列信息以及gene、snp等注釋信息；家蠶基因組數據收錄了基因組所自產的Bombyx moi物種的contig原始數據以及gene注釋等數據；家雞基因組數據收錄了基因組所自產的三個不同種類雞（肉雞、蛋雞、烏雞）的原始序列信息以及這三個物種在cDNA、gene等之間的差異信息；流感病毒基因組數據收錄了覆蓋中國、美國、澳大利亞等111個國家，時間從1902年到2006年間的禽流感和豬流感的cds、segment、utr以及蛋白質等數據，數據有一部分為基因組研究所自產數據，另外一部分來源於NCBI；人類基因組多態性數據收錄了人的hg18版本的dbSnp數據，該部分數據來源於NCBI和ENSEMBL。
