簡型外膜蛋白質生物信息學

《簡型外膜蛋白質生物信息學》是2007年國防工業出版社出版的圖書，作者是孟朝暉。本書用生物信息學的方法研究筒型外膜蛋白質，詳細介紹了筒型外膜蛋白質的基本結構和功能。

基本介紹

• 書名：簡型外膜蛋白質生物信息學
• 作者：孟朝暉
• ISBN：9787118050349
• 類別：科學與自然 > 生物科學
• 頁數：276
• 出版社：國防工業出版社
• 出版時間：2007-04-01
• 裝幀：平裝

內容簡介

筒型外膜蛋白質是廣泛存在於革蘭氏陰性菌、線粒體和葉綠體外膜的結構類似筒型的蛋白質，研究這種蛋白質的結構和功能對於了解細胞內物質和能量的運作機理十分重要。本書包含結構模型、角度模型、側鏈旋轉異構體等，對目前已知三維結構的筒型外膜蛋白質分為10種類型詳細介紹，還研究了筒型蛋白質OmpA的摺疊過程。分別用神經網路模型、隱馬氏模型及根據蛋白質的物理化學特性抽象出的幾種結構辨識模型，分析了蛋白質的結構。為了方便不同學科的讀者能夠較為順利地閱讀本書，其中涉及到的相關基礎知識均有適當介紹，包括蛋白質基礎知識和蛋白質資料庫PDB 的相關內容，神經網路模型和隱馬氏模型的基本內容也有簡明闡述。

目錄

第1章 蛋白質簡介

1.1 胺基酸

1.2 肽鏈

1.3 肽鍵的空間結構與β-摺疊

第2章 蛋白質資料庫PDB

2.1 PDB數據格式

2.2 序列和原子坐標記錄

2.3 蛋白質二級結構數據

2.4 注釋記錄

2.5 連線類記錄

第3章 β-筒型外膜蛋白質

3.1 β-筒型外膜蛋白質的結構

3.2 良筒型外膜蛋白質的功能

3.3 β-摺疊股的N端和C端不對稱

3.4 角度模型

3.5 側鏈旋轉異構體

第4章 β-筒型外膜蛋白質的數據

4.1 OMPA超族

4.2 OMP超族

4.3 Autotransporter超族

4.4 OMPLA超族

4.5 Tsx超族

4.6 長鏈脂肪酸轉運蛋白族

4.7 寡糖轉運蛋白族

4.8 孔蛋白族

4.9 麥芽糖孔蛋白族

4.10 配體門控通道蛋白族

4.11 附錄

第5章 β-筒型外膜蛋白質的摺疊

5.1 OmpA的SDS-OG-DMPC摺疊過程

5.2 OmpA的UREA-DMPC摺疊過程

5.3 OmpA摺疊的3箇中間過程

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