穿膜區域

穿膜區域是指穿膜蛋白多肽鏈中穿越質膜的地方。多為α螺旋構象插在脂雙層內部，也有的以β摺疊片層構象穿越膜形成筒狀結構。一般具有跨膜的多肽區的內在膜蛋白稱之穿膜蛋白，這是參與跨膜轉運和信號傳遞的蛋白質所必須具備的特徵。單段穿膜蛋白通過唯一一個跨膜的肽段被錨定在脂雙層上。

細菌視紫紅質蛋白是一個典型的多段穿膜蛋白，這個蛋白是一個光碟機動的質子泵，它位於嗜鹽細菌的質膜中。細菌視紫紅質蛋白利用光能產生一個跨膜的可以驅動ATP合成的質子濃度梯度的形成，該蛋白的三維結構已經通過電子顯微鏡確定了。有7個跨膜的a-螺旋片段，每個片段大約含有25個胺基酸殘基。