福建社會科學院是福建省唯一綜合性社會科學研究機構。 福建省曾於１９６０年７月成立中國科學院福建分院哲學社會科學學部，該學部於１９６２年撤消。１９７８年２月重建福建省哲學社會科學研究所。１９８２年４月改稱福建社會科學院至今。
福建社會科學院的主要任務是以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論為指導，在人文與社會科學領域進行基礎理論研究、套用研究、對策研究和諮詢服務，注重從福建實際出發，為地方領導決策服務，為地方經濟社會發展服務，為實現祖國統一大業服務。圍繞建設有中國特色社會主義理論研究總課題，進一步加強經濟、社會、精神文明、法學和有福建特色的台灣、華僑等問題的研究，逐步形成自己
的研究優勢，在某些學科和研究領域達到全國領先水平。
我院除承擔一定數量的國家、省社會科學規劃研究項目外，還根據實際需要和各所、室、中心的特點及其發展、確定院重點項目和所重點項目。同時積極承擔省委、省政府調研課題和有關部門提出和委託的重大理論問題和實際問題。福建社會科學院目前設有９個研究所２個直屬研究室：經濟研究所、亞太經濟研究所、華僑華人研究所、現代台灣研究所、文學研究所、歷史研究所、哲學研究所、社會學研究所、精神文明建設研究所、法學研究室、三角號碼辭書編輯室。
此外還設有１０個研究中心：鄧小平理論研究中心、中國與海上絲綢之路研究中心、福建台灣文化研究中心、決策科學研究中心、客家研究中心、管理科學研究中心、公共關係研究中心、法律研究諮詢中心、福建中華茶文化研究中心和法國遠東學院福州中心。
福建社會科學院下設圖書、出版機構有：文獻信息中心、《福建論壇》雜誌社、《亞太經濟》編輯部，出版國內外公開發行刊物《福建論壇.經濟社會片》月刊、 《福建論壇.文史哲版》雙月刊、《亞太經濟》雙月刊、《現代台灣研究》季刊、另外還有內部發行的刊物《客家》、《華僑華人與僑務》、《信息窗》等內刊。
福建社會科學院設有省紀委派出機構－－紀檢組和設有以下黨政部門和群團組織：辦公室、科研組織處、人事處、機關黨委、院工會、婦委會、團支部。福建社會科學院現有人員１６１人，其中科研和文獻信息、刊物編輯人員１２３人，副研究員以上各類高級專業人員48人，離退休的副研究員以上各類高級專業人員３４人。國家級專家２人。省優秀專家６人，享受政府特殊津貼的專家19人。
在科研條件和設備方面，已有辦公用房１０１８７平方米，職工宿舍13836平方米。科研手段現代化逐步得到了加強，完成了圖書自動化設備安裝調試工作，各所、室、處都配備了電腦，圖書館區域網路已初步完成，建有國內學術期刊、台港期刊閱覽室、經濟學閱覽室、光碟閱覽室等， 文獻信息中心館藏圖書總計近２０萬冊，訂有國內報刊５００多種，原版港台外文報刊１1８種。
截止2000年統計，該院已出版各類書籍218部（包括專著、論文集、譯著、工具書、普及讀物等），發表論文、研究報告等8030篇。共有289項科研成果獲得各級各類獎勵，其中118項成果獲得省部級以上獎勵。截止１９９9年底，我院研究人員出國（境）參加學術會議、進行學術訪問和合作研究共166人次，去過２４個國家和地區（美國、加拿大、英國、法國、瑞士、比利時、前蘇聯、日本、韓國、伊朗、阿曼、埃及、巴基斯坦、斯里蘭卡、印度、泰國、馬來西亞、 菲律賓、印度尼西亞、汶萊、新加坡及香港、澳門、台灣）；有３０個國家和地區的學者601人次訪問我院（主要來自聯合國、美國、加拿大、澳大利亞、紐西蘭、英國、法國、德國、荷蘭、義大利、比利時、瑞士、瑞典、前蘇聯、波蘭、匈牙利、土耳其、伊朗、日本、韓國、阿曼、科威特、以色列、菲律賓、印度尼西亞、塞內加爾以及香港、澳門、台灣）。
該院舉辦過多次國際、境外學術研討會，主要有：“鄭成功研究”國際學術討論會；全國第二次台灣香港文學學術討論會；“林則徐誕辰２００周年”國際學術討論會；“朱子學研究”國際學術討論會；紀念朱熹誕辰８６０周年國際學術討論會；“中國與海上絲綢之路”國際學術討論會；“九十年代的台灣暨海峽兩岸關係”研討會；“海上絲綢之路與伊斯蘭文化”國際學術討論會；“中國與東南亞”學術討論會；“洋務運動”國際學術討論會；“台灣開發史”研討會。
