福州捷運6號線起於潘墩，止於國際學校，線路全長36.5公里，設站22座，是福州主城與濱海新城軌道交通聯繫骨幹線。途經三江口、長樂、濱海新城等組團，是城市東擴發展戰略的保障項目，引向城市沿江向海發展，引導和支持長樂、濱海地區開發建設。
6號線起於潘墩站，該站位於潘墩路、林浦路交叉口，設站前單渡線、站後折返線。
線路出站後向東，沿林浦路行至原福泉高速公路收費口，於福泉連線線北半幅設林浦站，與軌道交通4號線同台換乘。結合北側地塊建設綜合交通樞紐。
線路沿福泉連線線東行至現狀蘆岐村附近設蘆岐站，站後設出入線接軌樟嵐停車場。然後線路繼續沿福泉連線線東行，至現狀梁厝村南側設梁厝站，與1 號線同台換乘。1、6 號線四線並行至下洋村設下洋站，與1 號線平行站廳換乘，車站北端設兩股道停車線，並與1 號線設聯絡線。
線路出站後下穿東部新城規劃軸線河道，過三江路後設峒口，之後上坡接道慶洲大橋。跨烏龍江段本線與道慶洲大橋共建（本項目不含道慶洲大橋土建部分）。共建段長約4.7km，橋樑採用分層布置，上層為道路路面，下層為軌交通道。過烏龍江後繼續結合大橋沿203省道敷設，隨後跨瀋海高速、三汊港，於省道S203、瀛洲路口東側設營前站，站台東側設單股道停車線。
線路繼續沿省道S203路中敷設，經長安路、長限村後設航城站。
之後繼續沿鄭和路東行，至奎橋路口設十洋站。
線路向東南轉向，至東鶴路、鰲山路口設鰲頭站。
出站後線路進入濱海新城，下穿嚴義山後至鶴梅線設鶴上站，站台東側設停車線。
線路過省道S203進入濱海新城，設沙京站、蓮花站、濱海新區站、壺井站、萬壽站，其中蓮花站西端設出入線接軌橫港車輛段，中間風井出一根八字線接軌橫港車輛段；萬壽站站台東側設兩股道折返線。
到達萬壽站後轉向南方，新設濱海北站、花亭站、濱海CBD站、沙尾站、金濱路站、國際學校站等六個站點，終點位於文武砂鎮的融僑國際雙語學校（融僑賽德伯學校）。
