祥雲縣農業局，內設8個機構，（其中祥雲縣畜牧局為正科級事業單位，祥雲縣農業產業化辦公室為副科級事業單位），是一種行政區域。
祥雲縣農業局內設8個機構，（其中祥雲縣畜牧局為正科級事業單位，祥雲縣農業產業化辦公室為副科級事業單位） 其主要職能分別為：
1、辦公室
負責檔案起擬、公文處理、檔案資料立卷歸檔、及工、青、婦、後勤及社會治安內務管理；承辦人事、工資業務、農業系列職稱改革業務工作、上情下達、下情上報、來信來訪、外事接待、協助領導處理機關內的臨時性事務，完成領導和上級機關安排的其它任務。
2、財務室
執行《會計法》，做好農業系統財務預算，管好、用好支農資金，對局屬單位的各項資金的開支情況進行監督審查。
3、生物資源開發辦公室
負責茶桑、果、藥及全縣生物資源開發、利用、保護、特色產業引進、示範推廣、生物資源開發中、長期規劃、計畫，制定生物資源開發、利用、保護措施，並組織實施，完成局臨時交辦的工作和上級業務主管部門交辦的工作任務。
4、農田建設辦公室
對應省州主管部門的職能，搞好高穩產農田基本建設規劃、計畫並檢查監督實施總結、有關項目報表編制匯總上報。
5、種植業股
負責農業、種子、植保等方面的中長期規劃，年度計畫、技術措施的擬定，組織實施及工作總結；農業產業結構調整項目的調研、編報和實施；組織協調開展農業新技術的引進、試驗、示範、推廣和農情統計工作，組織協調對基層農科站人員和農戶的技術培訓、科教工作；收集、整理、總結、上報有關農業方面的材料；做好全縣農業區劃和土地利用規劃；完成領導臨時安排的其它工作和上級機關及業務主管部門交辦的其它工作任務。
6、農機股
負責農機培訓、推廣，農機監理方面的中長期規劃，年度計畫、推廣方案的擬定，組織實施及工作總結；組織協調開展農用新機具的引進、試驗、示範、推廣；指導農機手的培訓、考核、管理，農用機械交通安全監理；組織對基層農機技術人員的培訓；收集、整理、總結、上報農機方面的材料，做好農機方面的統計及雲南省廣播電視學校祥雲分校招生，祥雲縣人民政府綠色證書工程領導組辦公室業務，完成局領導臨時交辦的工作和上級機關業務主管部門交辦的其它工作任務。
7、畜牧局（正科級）
畜牧局是縣人民政府管理全縣畜牧業生產的事業單位，負責全縣畜牧業生產計畫、規劃的編制並組織實施；畜牧業技術推廣服務，負責畜牧獸醫的行政執法管理，縣鄉（鎮）、村畜牧獸醫服務體系、行政、人事、勞動工資管理。
1、辦公室
負責檔案起擬、公文處理、檔案資料立卷歸檔、及工、青、婦、後勤及社會治安內務管理；承辦人事、工資業務、農業系列職稱改革業務工作、上情下達、下情上報、來信來訪、外事接待、協助領導處理機關內的臨時性事務，完成領導和上級機關安排的其它任務。
2、財務室
執行《會計法》，做好農業系統財務預算，管好、用好支農資金，對局屬單位的各項資金的開支情況進行監督審查。
3、生物資源開發辦公室
負責茶桑、果、藥及全縣生物資源開發、利用、保護、特色產業引進、示範推廣、生物資源開發中、長期規劃、計畫，制定生物資源開發、利用、保護措施，並組織實施，完成局臨時交辦的工作和上級業務主管部門交辦的工作任務。
4、農田建設辦公室
對應省州主管部門的職能，搞好高穩產農田基本建設規劃、計畫並檢查監督實施總結、有關項目報表編制匯總上報。
5、種植業股
負責農業、種子、植保等方面的中長期規劃，年度計畫、技術措施的擬定，組織實施及工作總結；農業產業結構調整項目的調研、編報和實施；組織協調開展農業新技術的引進、試驗、示範、推廣和農情統計工作，組織協調對基層農科站人員和農戶的技術培訓、科教工作；收集、整理、總結、上報有關農業方面的材料；做好全縣農業區劃和土地利用規劃；完成領導臨時安排的其它工作和上級機關及業務主管部門交辦的其它工作任務。
6、農機股
負責農機培訓、推廣，農機監理方面的中長期規劃，年度計畫、推廣方案的擬定，組織實施及工作總結；組織協調開展農用新機具的引進、試驗、示範、推廣；指導農機手的培訓、考核、管理，農用機械交通安全監理；組織對基層農機技術人員的培訓；收集、整理、總結、上報農機方面的材料，做好農機方面的統計及雲南省廣播電視學校祥雲分校招生，祥雲縣人民政府綠色證書工程領導組辦公室業務，完成局領導臨時交辦的工作和上級機關業務主管部門交辦的其它工作任務。
7、畜牧局（正科級）
畜牧局是縣人民政府管理全縣畜牧業生產的事業單位，負責全縣畜牧業生產計畫、規劃的編制並組織實施；畜牧業技術推廣服務，負責畜牧獸醫的行政執法管理，縣鄉（鎮）、村畜牧獸醫服務體系、行政、人事、勞動工資管理。
8、農業產業化建設辦公室
根據農業產業化政策，制定我縣農業產業化開發的具體措施並組織實施，推進農業產業化經營；制定農業產業化的年度計畫和中長期規劃；牽頭組織農業產業化項目的調研、立項、申請，組織協調好項目實施，提供配套服務以及檢查督促；負責亞麻產業、馬鈴薯產業以及農業產業化後續產業的培植，完成農業局交辦的其他工作任務。
根據農業產業化政策，制定我縣農業產業化開發的具體措施並組織實施，推進農業產業化經營；制定農業產業化的年度計畫和中長期規劃；牽頭組織農業產業化項目的調研、立項、申請，組織協調好項目實施，提供配套服務以及檢查督促；負責亞麻產業、馬鈴薯產業以及農業產業化後續產業的培植，完成農業局交辦的其他工作任務。
農業局局屬站所職責（局屬9個站所）
1、縣農科所（土肥站）
負責全縣農業產業結構調整的新品種、新技術的引進、試驗、篩選、示範、推廣；全縣土壤養分分析、監控，測土配方施肥及指導全縣施肥技術和土壤肥力的培肥工作；傳統農業技術的更新改進和新技術的組裝配套；負責農業實用技術的培訓、推廣及技物配套工作；化肥市場的監督管理及農業科技諮詢服務工作。
2、縣植保站
負責全縣病、蟲、草、鼠害的預測預報，植物檢疫，植保新技術引進、試驗、示範、推廣；農藥市場管理；種子、苗木和其他繁殖材料的繁育基地執行產地檢疫；應施檢疫的植物、植物產品的調運檢疫，及復檢業務；監督和指導引種單位進行消毒處理和隔離試種；監督指導有關部門建立無檢疫對象的種子、苗木繁育、生產基地；做好植保植檢的技物配套服務及農業植保科技諮詢服務。
3、縣園藝工作站
負責全縣蔬菜產業及水果產業的開發；蔬菜、水果新技術的引進、試驗、示範、推廣，搞好技物配套及技術諮詢服務工作。
4、縣農機監理站
負責全縣農機安全監理、農機牌證管理、監製、核發，農機轉籍登記，農機操作人員考核發證，檔案管理，年檢年審，農機報廢與更新，農機操作員技能培訓、崗位輪訓、資格審定，農機收費審計，農機規費使用監督，宣傳農機法規。
5、縣農機技術培訓推廣站（縣農機化學校）
負責組織全縣農機化技術的套用，實施農機新技術、新機具的引進、試驗、示範、推廣，農機產品質量測試，農機技術儲備、人員培訓、技術諮詢服務，圍繞全縣農業產業結構調整，進行機收、機耕、機耙的各項服務工作。
6、縣種子站
負責全縣新品種的試驗、示範、推廣、良種生產、經營、種子市場管理，良種繁育、技術培訓，與農作物種子相關的技物配套服務工作。
7、縣農業環境監測站。
負責全縣生態農業建設的試驗、示範、推廣、培訓；無公害農產品，綠色食品的開發、申報、管理及基地建設的技術指導；全縣農業環境監測及依法開展農業環境保護工作
8、縣經管站
負責全縣農業土地承包管理，農業、農村經濟信息統計和農產品成本核算，農村集體資產管理、農民負擔監督管理、農業會計管理、村級會計人員培訓、農村財務管理，農村政策宣傳等
9、縣茶桑工作站
負責全縣蠶桑產業的規劃、計畫，蠶桑技術培訓、試驗、示範、推廣；蠶桑產業產前、產中、產後的系列化服務及茶葉及藥材產業的規劃、計畫和開發研究工作。
1、縣農科所（土肥站）
負責全縣農業產業結構調整的新品種、新技術的引進、試驗、篩選、示範、推廣；全縣土壤養分分析、監控，測土配方施肥及指導全縣施肥技術和土壤肥力的培肥工作；傳統農業技術的更新改進和新技術的組裝配套；負責農業實用技術的培訓、推廣及技物配套工作；化肥市場的監督管理及農業科技諮詢服務工作。
2、縣植保站
負責全縣病、蟲、草、鼠害的預測預報，植物檢疫，植保新技術引進、試驗、示範、推廣；農藥市場管理；種子、苗木和其他繁殖材料的繁育基地執行產地檢疫；應施檢疫的植物、植物產品的調運檢疫，及復檢業務；監督和指導引種單位進行消毒處理和隔離試種；監督指導有關部門建立無檢疫對象的種子、苗木繁育、生產基地；做好植保植檢的技物配套服務及農業植保科技諮詢服務。
3、縣園藝工作站
負責全縣蔬菜產業及水果產業的開發；蔬菜、水果新技術的引進、試驗、示範、推廣，搞好技物配套及技術諮詢服務工作。
4、縣農機監理站
負責全縣農機安全監理、農機牌證管理、監製、核發，農機轉籍登記，農機操作人員考核發證，檔案管理，年檢年審，農機報廢與更新，農機操作員技能培訓、崗位輪訓、資格審定，農機收費審計，農機規費使用監督，宣傳農機法規。
5、縣農機技術培訓推廣站（縣農機化學校）
負責組織全縣農機化技術的套用，實施農機新技術、新機具的引進、試驗、示範、推廣，農機產品質量測試，農機技術儲備、人員培訓、技術諮詢服務，圍繞全縣農業產業結構調整，進行機收、機耕、機耙的各項服務工作。
6、縣種子站
負責全縣新品種的試驗、示範、推廣、良種生產、經營、種子市場管理，良種繁育、技術培訓，與農作物種子相關的技物配套服務工作。
7、縣農業環境監測站。
負責全縣生態農業建設的試驗、示範、推廣、培訓；無公害農產品，綠色食品的開發、申報、管理及基地建設的技術指導；全縣農業環境監測及依法開展農業環境保護工作
8、縣經管站
負責全縣農業土地承包管理，農業、農村經濟信息統計和農產品成本核算，農村集體資產管理、農民負擔監督管理、農業會計管理、村級會計人員培訓、農村財務管理，農村政策宣傳等
9、縣茶桑工作站
負責全縣蠶桑產業的規劃、計畫，蠶桑技術培訓、試驗、示範、推廣；蠶桑產業產前、產中、產後的系列化服務及茶葉及藥材產業的規劃、計畫和開發研究工作。
