在
大西軍聯合南明朝廷共同抵抗清軍的同時，東南沿海的鄭成功部隊也展開了對清軍的反擊。
永曆五年(1651年)五月，鄭成功率領明軍出擊
閩南，並於當月二十五日進入
海澄境內的
磁灶。清
漳州總兵
王邦俊也率一千騎兵、二千步兵，於二十六日抵達磁灶附近，與明軍對峙。鄭成功料定清軍驕傲輕敵，便決定採用伏擊戰術，他派一鎮兵力埋伏於磁灶山坑南，一鎮兵力埋伏於磁灶坑北，兩鎮鎮兵力埋伏於磁灶社內，另派三鎮兵力前往誘敵。清軍果然中計，雖然清軍憑藉
騎兵頑抗，但鄭成功部隊裝備了
藤甲兵，即以三人為一組，一人執藤牌掩護，一人砍馬，一人砍人。在明軍猛烈的攻擊之下，清軍潰不成軍，王邦俊率領敗軍落荒而逃，明軍取得了磁灶大捷的勝利。
磁灶大捷大大鼓舞了閩南的抗清民眾，鄭軍舊將
黃興、
黃梧先後歸附鄭成功。而鄭成功叔父
鄭鴻逵也倍感欣慰，將其部分兵力撥給鄭成功。
