急性直腸炎長期不愈，則變為慢性直腸炎。直腸黏膜及其下層肥厚者，為慢性肥大性直腸炎；如直腸內的腸腺及其間質萎縮改變者，稱為慢性萎縮性直腸炎。
一、症狀
便秘與腹瀉交替，便中含有粘液及血絲，大便時肛門口灼痛。因分泌物刺激，肛門周圍表皮脫落，有時成裂口發癢，下腹部脹滿不適，食欲不振，體重減輕，全身不適。
二、診斷
指診可觸到直腸黏膜彈性減弱，粗糙呈顆粒狀突起或有疤痕。直腸鏡檢查可見黏膜水腫、肥厚，色黃白，被覆粘液，擦去粘液，可見黏膜表面不光滑，個別部位有糜爛。細菌培養和活體組織檢查，可確定病因診斷。
慢性直腸炎鏡檢的特點是：黏膜腫脹、肥厚，表面呈粗糙顆粒，有少量粘液，萎縮性直腸炎鏡下可見：黏膜乾燥、色灰白，黏膜下可見血管網。
三、治療
(一)調理：病人適當休息，進清淡、少渣、營養豐富、無刺激性的食物，並做到心情愉快，勞逸結合。
(二)全身治療：
1.可根據病情口服、肌注或靜滴抗生素。
2.中藥治療：
(1)慢性期體虛無力，以排粘液為主。常用方劑有：太子參、炙黃芪、白朮、甘草、罌栗殼、白芍、石榴皮、明礬，水煎內服，1日2次。
(2)慢性直腸炎急性發作時，予以清熱解毒、潤腸通便。里急後重，便次多者用枳實導滯丸清理盪積。
(三)局部治療：
直腸黏膜水腫者，可用生理鹽水、0.5-1％鞣酸、1：5000高錳酸鉀溶液灌洗直腸。黏膜糜爛者，可塗以％醋酸可的松溶液或10％硝酸銀溶液。括約肌、肛提肌痙攣 者，可將溫橄欖油注入直腸內。直腸黏膜萎縮變乾者，可每晚於 直腸內注入0.5％薄荷油適量。臨床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黃霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌腸，每天2次，有很好的療效。
