盧坤，四川綿竹人。博士，博士後，副研究員，碩士研究生導師。美國植物生物學家學會會員、中國遺傳學會會員、重慶市遺傳學會會員、重慶市高等學校青年骨幹教師。
基本介紹
- 中文名：盧坤
- 國籍：中國
- 民族：漢族
- 性別：男
學習經歷,工作經歷,研究方向,主持科研項目,國際學術會議報告,其他學術經歷,研究生招生專業,
學習經歷
1998-2002：西南農業大學農學與生物科技學院，農學學士
2002-2008：西南大學農學與生物科技學院，農學博士（導師：李加納教授）
工作經歷
2009-2010：西南大學農學與生物科技學院，生物學博士後（導師：李加納教授）
2012-2013：Department ofHorticulture and Landscape Architecture, Purdue University, Postdoctoral fellow (導師：Zhu Jian-Kang教授、美國科學院院士)碩士研究生導師
研究方向
1.油菜抗逆分子生物學
2.十字花科植物比較與功能基因組學
3.擬南芥表觀遺傳學
主持科研項目
1.國家自然科學基金：甘藍型油菜組織特異型啟動子的分離與鑑定，2012年-2014年
2.國家高技術研究發展計畫（863計畫）子課題：大豆、油菜、花生功能基因組研究與套用，2012年-2016年
3.教育部博士點新教師基金：甘藍型油菜BnPAP12基因家族根際有機磷利用的分子機制，2011年-2013年
4.重慶市自然科學基金：甘藍型油菜BnSKIPa基因家族的耐旱分子機理研究，2012年-2014年
5.重慶市高等學校青年骨幹教師資助計畫：甘藍型油菜組織特異型啟動子的分離與鑑定，2012年-2013年
6.中國博士後科學基金：芸薹屬禹氏三角物種中受磷飢餓誘導的PAP12基因家族的功能進化研究，2009年-2010年
7.西南大學博士基金：甘藍型油菜BnSKIPa基因家族的耐旱分子機理研究，2010年-2013年
8.貴州省菸草科學研究所合作項目：貴州省不同風格特色菸葉形成的分子機制研究，2011年-2013年
9.西南大學基本科研業務費團隊項目：基於代謝譜和比較基因組學的芸薹屬木質素代謝途徑基因的功能進化研究，2012年-2014年
10.西南大學基本科研業務費一般項目：甘藍型油菜BnPAP12基因參與磷高效利用的分子機理研究，2011年-2012年
近5年發表論文
1.Lei B,Lu K, Ding F, Zhang K, Chen Y, Zhao H, Zhang L, Ren Z, Qu C, Guo W, Wang J, Pan W* (*Corresponding Author) (2014) RNA sequencing analysis reveals transcriptomic variations in tobacco (Nicotiana tabacum) leaves affected by climate, soil, and tillage factors.International Journal of Molecular Sciences15(4): 6137-6160. IF2013=2.464
2.Lei M, La H,Lu K, Wang P, Miki D, Ren Z, Duan CG, Wang X, Tang K, Zeng L, Yang L, Zhang H, Nie W, Liu P, Zhou J, Liu R, Zhong Y, Liu D, Zhu JK*. (2013)Arabidopsis EDM2promotesIBM1distal polyadenylation and regulates genome DNA methylation patterns.PNAS111(1): 527-32. IF2013=9.737
3.Shengyi Liu, Yumei Liu, Xinhua Yang, Chaobo Tong, David Edwards, Isobel Parkin, Meixia Zhao, Jingyin Yu, Shunmou Huang, Xiyin Wang, Junyi Wang,Kun Lu, Zhiyuan Fang, Ian Bancroft, Tae-Jin Yang, Qiong Hu, Xinfa Wang, Zhen Yue, Haojie Li, Linfeng Yang, Jianxin Ma, Jian Wu, Qing Zhou, Wanxing Wang, Graham King, J. Chris Pires, Changxin Lu, Zhangyan Wu, Sampath Perumal, Zhuo Wang, Hui Guo, Shengkai Pan, Limei Yang, Jiumeng Min, Dong Zhang, Dianchuan Jin, Wanshun Li, Harry Belcram, Jinxing Tu, Mei Guan, Cunkou Qi, Dezhi Du, Jiana Li, Liangcai Jiang, Jacqueline Batley, Andrew Sharpe, Beom-Seok Park, Ruperao Pradeep, Feng Cheng, Nomar Waminal, Ying Huang, Caihua Dong, Li Wang, Jingping Li, Zhiyong Hu, Mu Zhuang, Yi Huang, Junyan Huang, Jiaqin Shi, Desheng Mei, Jing Liu, Tae-Ho Lee, Jinpeng Wang, Huizhe Jin, Zaiyun Li, Xun Li, Jiefu Zhang, Xiao Lu, Yongming Zhou, Zhongsong Liu, Xuequn Liu, Rui Qin, Xu Tan, Wenbin Liu, Yupeng Wang, Yangyong Zhang, Jonghoon Lee, Hyun Hee Kim, France Denoeud, Xun Xu, Xinming Liang, Wei Hua, Xiaowu Wang, Jun Wang, Boulos Chalhoub, Andrew Paterson TheBrassica oleraceagenome reveals the asymmetrical evolution of polyploid genomes.Nature Communications (accepted). IF2013=10.015
4.Lei B, Zhao XH, Zhang K, Zhang J, Ren W, Ren R, Ren Z, Chen Y, Zhao HN, Pan WJ, Chen W, Li HX, Ding FZ*,Lu K*. (Corresponding Author) (2013) Comparative transcriptome analysis of tobacco (Nicotiana tabacum) leaves to identify aroma compound-related genes expressed in different cultivated regions.Molecular Biology Reports40: 345-357. IF2013=2.506
5.Qu C, Fu F,Lu K, Zhang K, Wang R, Xu X, Wang M, Lu J, Wan H, Tang Z, Li J*. (2013) Differential accumulation of phenolic compounds and expression of related genes in black- and yellow-seededBrassica napus.Journal of Experimental Botany64(10): 2885-2898. IF2013=5.242
6.Zhang K,Lu K, Qu C, Liang Y, Wang R, Chai Y, Li J*. (2013) Gene silencing ofBnTT10family genes causes retarded pigmentation and lignin reduction in the seed coat ofBrassica napus.PLoS ONE8(4): e61247. IF2013=3.73
7.Mei J, Ding Y,Lu K, Wei DY, Liu Y, Disi JO, Li JN, Liu LZ, Liu SY, McKay J, Qian W*. (2013) Identification of genomic regions involved in resistance againstSclerotinia sclerotiorumfrom wildBrassica oleracea.Theoretical and Applied Genetics126(2): 549-556. IF2013=3.658
8.Huang S, Deng L, Guan M, Li J,Lu K, Wang H, Fu D, Mason AS, Liu S, Hua W*. (2013) Identification of genome-wide single nucleotide polymorphisms in allopolyploid cropBrassica napus.BMC Genomics2013, 14: 717. IF2013=4.397
9.Wang X, Duan, CG, Tang K, Wang B, Zhang H, Lei M,Lu K, Mangrauthia SK, Wang P, Zhu G, Zhao Y, Zhu JK*. (2013) An RNA-binding protein regulates plant DNA methylation by controlling mRNA processing at intronic heterochromatin-containing genes.PNAS110(38): 15467–15472. IF2013=9.737
10.Wei LJ, Xiao ML, Mason AS, Ma B,Lu K, Li JN, Katrin L, Fu DH (2013) Characterization and evolutionary analysis ofBrassicaspecies-diverged sequences containing simple repeat units.Genes & Genomics35(2): 167-175. IF2013=0.497
11.Lu K, Qu CM, Zhang K, Lu JX, Chai YR*, Li JN* (2011) Expression quantitative trait loci analysis ofBAN,F3HandTT19genes inBrassica napus, Proceedings of 13International Rapeseed Congress, ed SPZO s.r.o. (Prague, Czech Republic), 949–952
12.Lu K, Chai YR, Zhang K, Wang R, Chen L, Lei B, Lu J, Xu XF, Li JN. (2008). Cloning and characterization of phosphorus starvation inducibleBrassica napus PURPLE ACID PHOSPHATASE 12gene family, and imprinting of a recently evolved MITE-minisatellite twin structure.Theoretical and Applied Genetics117: 963–975. IF2013=3.658
13.Lu K, Li JN, Zhong WR, Zhang K, Fu FY, Chai YR (2008) Isolation, characterization and phosphate-starvation inducible expression of potentialBrassica napus PURPLE ACID PHOSPHATASE 17(BnPAP17) gene family.Botanical Studies49: 199–213. IF2013=0.864
14.陸俊杏,盧坤,朱斌,彭茜,陸奇豐,曲存民,殷家明,李加納,梁穎*,柴友榮* (2013)芸薹屬物種（B. napus,B. oleracea,B. rapa）MAPK1家族的克隆、進化和表達特徵.中國農業科學46(16):3478−3487
15.陸俊杏,陸奇豐,張凱,柴友榮,李加納,錢偉,呂俊,盧坤*,梁穎* (2013)甘藍型油菜MAPK1在損傷和病原菌脅迫下的表達模式分析.中國農業科學2013, 46(20):4388-4396
16.朱斌,陸俊杏,彭茜,翁昌梅,王淑文,余浩,李加納,盧坤*,梁穎* (2013)甘藍型油菜MAPK7基因家族及其啟動子的克隆與表達分析.作物學報39(5): 789−805
17.曲存民,付福友,盧坤,謝景梅,劉曉蘭,黃杰恆,李波,王瑞,諶利,唐章林,李加納* (2011)不同環境中甘藍型油菜種皮木質素含量的QTL定位.作物學報37, 1398−1405
18.盧坤,張凱,柴友榮,陸俊杏,唐章林,李加納* (2010)甘藍和白菜紫色酸性磷酸酶17基因家族的克隆和比較分析.作物學報36, 517−525
19.陸俊杏,盧坤*,張凱,曹廷,李加納,梁穎* (2010)甘藍型油菜SAMDC3基因及其啟動子的克隆與分析.基因組學與套用生物29(2), 215-224
國際學術會議報告
1. Lu K. Differential accumulation of phenolic compounds and expression of related genes between the black- and yellow-seededBrassica napus, Initialization Meeting of Crop Germplasm Resources Utilization and Innovation Base (CGRUIB) Programme, July 17-19, 2012, Chongqing, P. R. China
2. Lu K. Expression quantitative trait loci analysis ofBAN,F3HandTT19genes inBrassica napus, 13th International Rapeseed Congress, June 5–9, 2011, Prague, Czech Republic
3. Lu K. Expression quantitative trait loci analysis ofBAN,F3HandTT19genes inBrassica napus, 17th Crucifer Genetics Workshop, Sept 5-8, 2010, Saskatoon, Canada
4. Lu K. Cloning and comparative analysis of phosphate-starvationBrassicaPAP12andPAP17gene families, Korea-China Joint Workshop on Brassica Genomics, Dec 8, 2009, Suwon, Republic of Korea
其他學術經歷
1. 2009年國際微管植物生物學大會會議秘書
2. 2012-至今中國博士後科學基金評審專家
3. 2013-至今美國植物生物學家學會會員、中國遺傳學會會員、重慶市遺傳學會會員
4. 2013-至今專業學術期刊《Journal of Experimental Botany》、《Journal of Integrative Plant Biology》、《Molecular Biology Reports》和《中國油料作物學報》等雜誌審稿專家
研究生招生專業
1.碩士研究生：植物分子生物學；植物表觀遺傳學；植物功能與比較基因組學
