《瘤牛抗病力分子機制研究》是科學出版社出版的圖書，作者是陳善元。
基本介紹
- 中文名：瘤牛抗病力分子機制研究
- 作者：陳善元
- 出版社：科學出版社
- ISBN：9787030644978
內容簡介,圖書目錄,
內容簡介
抗病育種是增強家養動物天然免疫力和抗病力的重要途徑。本書圍繞分子遺傳學的中心法則，從候選基因、DNA 甲基化、micro RNA、蛋白質組學4 個層面來解析瘤牛抗病力的分子機制，為培育抗病力強的家牛新品種提供科學依據和關鍵技術支撐。
圖書目錄
第1章 家牛品種資源概況1
1.1 普通牛和瘤牛的外形差異 1
1.2 普通牛和瘤牛的抗病力差異 2
參考文獻 2
第2 章 候選基因、DNA甲基化、microRNA與蛋白質組學簡況 4
2.1 候選基因 4
2.1.1 Toll樣受體家族 4
2.1.2 RLR家族 7
2.2 DNA甲基化 9
2.2.1 DNA甲基化的定義與特徵 9
2.2.2 DNA甲基化在哺乳動物中的套用 10
2.3 microRNA 11
2.3.1 microRNA的定義 11
2.3.2 microRNA的作用 12
2.3.3 microRNA在家牛中的套用 13
2.4 蛋白質組學 15
2.4.1 蛋白質組學在家牛疫病方面的研究進展 15
2.4.2 蛋白質組學在家畜研究中的套用 18
參考文獻 19
第3章 候選基因序列變異與普通牛和瘤牛間抗病力差異分析 28
3.1 Toll樣受體基因序列變異與雲南普通牛和瘤牛間抗病力差異分析 28
3.1.1 材料與方法 28
3.1.2 結果與分析 31
3.1.3 討論.41
3.2 RIG-Ⅰ樣受體基因序列變異與雲南普通牛和瘤牛間抗病力差異分析 44
3.2.1 材料與方法 44
3.2.2 結果與分析 44
3.2.3 討論 53
參考文獻 53
第4 章 基於全基因組重亞硫酸鹽測序的普通牛與瘤牛的DNA甲基化差異分析 56
4.1 材料與方法 56
4.1.1 實驗材料 56
4.1.2 實驗方法 56
4.1.3 數據分析 57
4.2 結果與分析 59
4.2.1 WGBS數據質量控制和序列比對 59
4.2.2 數據統計和覆蓋度分析 60
4.2.3 甲基化C分布趨勢分析 61
4.2.4 鹼基偏好性 66
4.2.5 甲基化圖譜 66
4.2.6 差異甲基化分析 68
4.2.7 GO功能分析 70
4.2.8 KEGG通路分析 72
4.3 討論 73
參考文獻 76
第5章 普通牛和瘤牛肝、脾組織中microRNA的鑑定及差異表達分析 78
5.1 材料與方法 78
5.1.1 實驗材料 78
5.1.2 實驗方法 78
5.1.3 數據分析 78
5.2 結果與分析 84
5.2.1 高通量測序數據結果 84
5.2.2 已知miRNA和新miRNA的鑑定及分析 85
5.2.3 各樣本miRNA的表達分析 86
5.2.4 已知miRNA和新miRNA的差異表達分析 88
5.2.5 差異表達已知miRNA的靶基因預測 89
5.2.6 差異表達已知miRNA靶基因的功能富集分析 90
5.2.7 RT-qPCR驗證miRNA的表達分析 96
5.3 討論 98
參考文獻 101
第6章 普通牛和瘤牛肝、脾組織的比較蛋白質組學研究 103
6.1 材料與方法 103
6.1.1 實驗材料 103
6.1.2 實驗方法103
6.1.3 數據分析105
6.2 結果與分析 107
6.2.1 肝、脾組織蛋白質的質譜結果 107
6.2.2 差異蛋白分析 108
6.2.3 蛋白質GO功能注釋分析 109
6.2.4 蛋白質KEGG通路分析 113
6.2.5 參與原蟲疾病通路的差異蛋白分析 119
6.2.6 PRM驗證差異蛋白的結果分析 121
6.3 討論 123
參考文獻 127
- 附錄
