生物質譜發掘肝癌中蛋白可變剪下標誌物研究

《生物質譜發掘肝癌中蛋白可變剪下標誌物研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院，由郝運偉擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：生物質譜發掘肝癌中蛋白可變剪下標誌物研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：郝運偉
• 依託單位：中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院

中文摘要

原發性肝細胞癌（HCC）在世界範圍內是第五位最常見和第三位致死率最高的惡性腫瘤，在我國每年肝癌新發和死亡病例均占全球一半以上。隨著研究的深入，愈來越多的證據顯示由可變剪下形成的蛋白質異構體在包括HCC在內的多種腫瘤形成中有著密切的聯繫，且由於其表達的特異性，具有著成為新一代診斷標誌物的重要的價值。但基於單基因或簡單篩選的傳統研究模式無法對其進行規模化的分析，造成許多參與HCC發病過程中的異構體被忽視。另一方面，已有的篩選策略主要集中於轉錄水平，缺乏蛋白質水平上的證據，因此對標誌物篩選和套用而言缺少了蛋白質驗證這重要的一環。新興的質譜策略- - -多反應離子監控（Multiple Reaction Monitoring，MRM）技術，為高通量的篩選和驗證可變剪下體提供了現實基礎。立足於本實驗的蛋白質組平台，結合質譜數據解析和驗證，我們可以從蛋白多樣性角度篩選相關的異構體作為臨床指標，從而提高診斷

結題摘要

肝細胞癌（HCC）在世界範圍內是第五位最常見和第三位致死率最高的惡性腫瘤。有關可變剪接對肝細胞癌的影響研究鮮有報導。在本研究中，我們首先通過理論的外顯子拼接，構建了目前最全面的剪接序列資料庫。然後，採用基於細胞培養胺基酸穩定同位素標記（SILAC）的蛋白質組學方法，我們在HCC97L和LM6肝癌高、低轉移細胞株中，共鑑定157個顯著差異表達的剪接亞型。與HCC轉移功能密切相關的候選標誌物中，我們驗證了三個剪接基因CEACAM1, ISOC2 和VPS29，其不同的剪接亞型在肝癌腫瘤和正常組織中表達差異顯著，進一步表明可變剪接亞型能夠成為肝癌新的分子標誌物。