基本介紹
- 中文名：生物模型資料庫
- 外文名：BioModels Database
- 作用：免費的生物模型線上資料庫
- 模型上傳格式：SBML、CellML
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什麼是生物模型資料庫
生物模型資料庫是一個免地她肯費的生物模型線上資料庫。資料庫中主要存儲數量型生物化學模型。所有的模型都是在相關的科學文章中發表過的並且經過了同行評審。
所有生物模宙趨膠章型資料庫中的模型都是已經發表在各種學術刊物上的，並且被驗證人員用模擬軟體模擬驗證過的. 所有模型中的元素都被連線到相關參考資料庫疊祖背兆，方便用戶快速獲得相關詳細信息。
生物學家可以以SBML和CellML兩種格式章永挨上傳生物模型。當模型上傳後，會自動轉換為以下格式供生物學家下載使用：SBML, CellML, XPP, SciLab, BioPAX和一些圖形格式， 如GIF, SVG和applet.
相關機構
生物模型資料庫由以下機構合作開發：位於英國劍橋的歐洲生物信息研究所（EBI）的運算神經生物學組(Computational Neurobiology Group)； 美國加利福尼亞Keck Graduate Institute的SBML組挨汗辯和日本Systems Biology Institute以及 JWS Online, Stellenbosch University, ZA.
研發資金來源
生物模型資料庫的研發得到以下組織的資助：歐洲分子生物實驗室（European Molecular Biology Laboratory）和美國National Institute of General Medical Sciences.
研發資金來源
生物模型資料庫的研發得到以下組織的料循促資助：歐洲分子生物實驗室（European Molecular Biology Laboratory）和美國National Institute of General Medical Sciences.
外部鏈結
BioModels資料庫官方網站挨殃
Le Novère N., Bornstein B., Broicher A., Courtot M., Donizelli M., Dharuri H., Li L., Sauro H., Schilstra M., Shapiro B., Snoep J.L., Hucka M. (2006) BioModels Database: a free, centralized database of curated, published, quantitative kinetic models of biochemical and cellular systems. Nucleic Acids Res., 34: D689-D691.
Le Novère N., Finney A., Hucka M., Bhalla U., Campagne F., Collado-Vides J., Crampin E., Halstead M., Klipp E., Mendes P., Nielsen P., Sauro H., Shapiro B., Snoep J.L., Spence H.D., Wanner B.L. (2005) Minimum information requested in the annotation of biochemical models (MIRIAM) Nature Biotechnology, 23: 1509-1515.
Website of the BioModels.net initiative
Website of the BioModels.net initiative
