生物分子構象自由能變化研究

《生物分子構象自由能變化研究》是依託華中科技大學，由陳長軍擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：生物分子構象自由能變化研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：陳長軍
• 依託單位：華中科技大學
• 負責人職稱：副教授
• 申請代碼：C0504
• 研究期限：2009-01-01 至 2011-12-31
• 批准號：30800166
• 支持經費：20（萬元）

中文摘要

複雜分子不同構像之間的自由能變化一直難以計算，我們嘗試利用最佳化路徑的思想，為解決這一問題提供可行方案。通過附加合理的約束勢函式，並採用高效結構最佳化算法，在多肽鏈特定狀態之間建立平滑路徑，繼而進行基於路徑積分方式的自由能計算，該方法可以有效避免傳統計算過程中嚴重的原子結構重疊現象，大大提高自由能計算的成功率，同時改善計算結果的收斂性。這對於分析複雜分子的構象自由能變化是一次十分有意義的嘗試；在新提出的自由能計算方法的輔助之下，分析不同二級結構的相對穩定性，以及該數值對環境溫度的依賴關係，總結多肽鏈穩定機制。