甘肅中醫藥大學馬克思主義學院成立於2016年3月，其前身是成立於1986年的社會科學部，是我校思想政治教育理論課的主要教學部門。
2018年5月，學院官方網站顯示，學院現有綜合辦公室、教學科研管理辦公室兩個行政科室和馬克思主義理論教研室、馬克思主義中國化教研室、思想道德修養與法律基礎教研室、形勢與政策教研室等4個教學機構。師資隊伍方面，現有教師27人。其中教授2人，副教授7人，講師18人。師資隊伍以中青年教師為主，具有碩士學位20人，學士學位7人。 學院現有學科涵蓋馬克思主義理論、思想政治教育兩個二級學科。開設有《馬克思主義哲學原理》、《毛澤東思想和中國特色社會主義理論》、《中國近現代史綱要》、《思想道德修養與法律基礎》4門思政課程以及《醫案說法》、《中醫哲學》、《西方哲學概論》等多門選修課程。
