甘南州食品藥品監督管理局內設辦公室、規劃財務科、法規監督科、藥品安全監管科、藥品市場監管科、食品監督許可科、醫療器械監管科等7個職能科室，下屬州食品藥品藥品檢驗檢測所、藥品醫療器械稽查分局、食品化妝品稽查分局和藥品不良反應監測中心4個直屬事業單位。
主要職責,內設機構,
主要職責
貫徹執行藥品、醫療器械、消費環節食品安全、保健食品和化妝品安全監督管理的法律、法規；參與擬訂食品藥品監督管理有關的地方性政策規定並監督實施；負責餐飲服務環節餐飲服務許可、準入和食品安全監督管理，組織查處餐飲服務環節違法違規行為；開展餐飲服務環節食品安全狀況調查和監測工作，報送餐飲服務環節食品安全監管信息；負責保健食品、化妝品衛生許可及衛生監督管理；負責藥品、醫療器械行政監督和技術監督，組織查處藥品、醫療器械研製、生產、流通、使用環節違法違規行為；貫徹執行藥品和醫療器械研製、生產、流通、使用方面的質量管理規範並監督實施；報送藥品、醫療器械質量安全信息；負責藥品和醫療器械經營許可；組織開展藥品不良反應和醫療器械不良事件監測；配合有關部門實施國家基本藥物制度，確保國家基本；組織實施處方藥和非處方藥分類管理制度；貫徹實施中(藏)藥質量管理規範；配合省食品藥品監督管理局組織實施中(藏)藥品種保護制度；依法監督管理麻醉藥品、精神藥品、醫療用毒性藥品、放射性藥品和藥品類易製毒化學品等特殊藥品；貫徹執行藥品從業人員資格準入制度，負責藥品零售從業資格認定及管理工作；指導、監督檢查各縣市藥品、醫療器械和餐飲服務環節食品安全、保健食品、化妝品等有關方面的監督管理工作。
內設機構
甘南州食品藥品監督管理局內設辦公室、規劃財務科、法規監督科、藥品安全監管科、藥品市場監管科、食品監督許可科、醫療器械監管科等7個職能科室，下屬州食品藥品藥品檢驗檢測所、藥品醫療器械稽查分局、食品化妝品稽查分局和藥品不良反應監測中心4個直屬事業單位。
