環境成本核算系統是指企業環境成本核算的運行方式。企業的環境成本核算是一個系統，該系統的運行需要理與企業環境管理體系的關係。所謂企業環境管理體系，是一種循環執行模式，包括環境管理日標的設立、環境管理方案的擬訂、環境管理方案的實施、環境管理業績評價等。環境成本核算系統在此體系中的主要任務是成本核算與管理，為業績評價，目標設定、方案擬定及實施控制提供不可缺少的信息傳遞決策、分析等平台支持。
企業環境成本核算系統的基本構成要求為:(1)環境成本枝算的目的是向企業利害相關人和社會公眾據示企業在執行國家環境保護法規和度以及處理企業與環境的關係中，為最佳化自身生產經營活動對環境造成的影響所發生的成本，以及與其相關的效益和效果信息，(2)環境成本的計算對象是指全業各作業環節所產生的環境負荷，或企業所發生的環境負荷總量。前者以作業成本法計算環境成本，後者則按環境負荷的物質項目或現象為對象計算環境成本，(3)環境成本的計算期是以一定的生產經營期間為限，(4)環境成本的確認一般要借於會計學理論的指導，同時要根據有關規定於以確認。(5)環境成本的計量一般按成本發生的性質採用差額計量、全額計量和按比例分配計量三種方法。(6)環境成本的報告應當設計規範的版面格式予以技露，其內容包括可以貨幣計最的部分，可以物理化學單位計量的部分和描述性部分。
