瑞應寺四大扎倉，蒙古族地區開展藏傳佛教教育的機構。在遼寧省阜新蒙古族自治縣佛寺鄉佛寺村。分設四個扎倉：（1）薩尼特扎倉，學習佛教哲理的因明學部。清乾隆三十年（1765）建立，藏有顯宗哲理五部經典以及木雕版，《甘珠經》三部 324 函，《丹珠經》三部 675 函。學僧先學習藏文字母，後習經文，時間需六七年。然後開始學習佛教哲理因明學。由師傅教，自己學，還要在經堂、法園中互相辯論、出題、答辯。學僧經過考試和辯經，合格者獲格西學位。依成績可分別授“茂喇姆冉旃巴”、“都冉巴”、“噶布楚”等三種格西學位。
（2）曼巴扎倉，醫學部。位於大雄寶殿東二華里山嶺上。康熙四十一年（1702）建立。殿中東壁上畫有以《四部醫典》為基本內容的枝幹型圖案，是該殿重要文物。其圖形由 3根、9乾、47枝、224葉、2枝花朵、3顆果實組成，形象地描繪了生理、病理相互關係。還有各種形狀的人體解剖圖， 以及大量的手術用具等。學僧學習經卷和醫療技術。（3）阿克巴扎倉，是密宗學院。嘉慶十七年（1812）建立。僧徒誦讀修煉密宗咒語，遵守戒律。從師傅受領咒語灌頂者，必須是受過比丘戒的僧人。在發誓不違犯密宗戒律後， 還要經受長期的考驗，師傅才傳授密宗灌頂。（4）丁科爾扎倉，時輪學部。研究天文、曆法、日蝕月蝕，編曆書，記載氣候變化。殿堂有主殿、藏經殿、時輪金剛殿和天王殿。學僧專門研究天文曆法，即《時輪曆法》，運用它推算出大小月份和 24節氣的交接時刻，並推算閏月和日蝕月蝕的準確時刻。丁科爾扎倉每年編寫一本《曆書》，發行蒙古各地傳抄使用。
