班禪大師為格魯派在西藏的兩大轉世活佛之一，四世班禪在格魯派取得西藏地方政權的過程中發揮了重要作用，固始汗贈給四世班禪以“班禪博克多”尊號，並賜給札什倫布寺許多莊園。清康熙五十二年(]713年)，康熙帝封五世班禪為“班禪額爾德尼”，並賜金印。雍正帝時準備將後藏地區封給五世班禪，五世班禪只接受了拉孜、昂仁、彭措林3個宗：頗羅鼐和珠爾墨特那木扎勒掌政時，又贈給班禪大師許多莊園。班禪大師的管轄區，由班禪大師領導下的班禪拉章管理，通常稱為拉章堅贊團波政權，有自己的一套管理機構和制度。清代時與前藏的甘丹頗章政權同屬駐藏大臣管轄。其直接管轄的宗溪有拉孜、昂仁、彭措林、謝通門、達納仁欽孜、崗巴、間隆、典倫熱、江孜查普、達木薩迦等。屬於班禪大師管轄的寺廟有200多座。
