汽車工程系是濟寧職業技術學院重點支持、重點建設的系。
濟寧職業技術學院是山東省首家開設高職汽車專業的高職院校。目前，本校汽車專業是辦學實力、社會影響力仍居全省前列，在2011年山東省全省專業綜合評估中位列全省第一，在全國也屬先進。
汽車工程系現有5個高職汽車專業：汽車檢測與維修技術、汽車技術服務與行銷、汽車定損與評估專業、汽車電子技術、汽車製造與裝配技術。其中汽車技術服務與行銷、汽車定損與評估兩專業與中銳教育集團合作辦學。校內配套有新、舊兩個汽車檢修實訓中心。舊汽車實訓中心於2004年改造後建築面積約3000平方米，設備價值300餘萬元。新汽車實訓中心建築面積1萬餘平方米，2010年9月投入使用，世界銀行支持設備960萬元。
汽車工程系現有專業教師52名，其中教授、副教授11人，高級工程師10人，博士2人，碩士34人，汽車維修技師18人，雙師型教師42名，人力資源和社會保障部職業技能考評員16人，中國汽車人才中心特聘教師8人，具備汽車高級職業資格的24人。另有企業兼職教授46名。
