海西蒙古族藏族自治州科學技術局是海西蒙古族藏族自治州人民政府工作部門。
海西蒙古族藏族自治州科技局內設辦公室、發展計畫科兩個行政科室及海西州科技情報研究室、海西州高原淡水養殖研究室、海西州科技進步獎評審委員會辦公室、海西州能源綜合利用研究室四個事業機構。
海西蒙古族藏族自治州科學技術局作為海西科技行政管理部門，其職責是：
一、執行國家和省上的巨觀戰略和科技工作的方針、政策、法規，推動建立適應社會主義精神文明建設、市場經濟和科技自身發展規律的科技創新體制和機制；
二、建立科普工作發展和科技服務體系，指導全州科技體制改革；
三、研究提出全州科技發展戰略，科技促進經濟與社會發展、全州科技體制改革方案、政策、措施；
四、組織編制全州科技發展的中長期規劃和年度科技項目計畫；
五、研究確定全州科技發展的布局和合作項目計畫；
六、研究多渠道增加科技投入的措施、科技人才資源的合理配置；
七、制定全州對外科技合作與交流的政策和措施；
八、負責全州歸口管理的科技三項費和科技項目經費等有關費用的預決算；
九、負責星火計畫、科技攻關計畫、軟科學計畫、高新技術及產業化發展計畫、成果推廣計畫等；
十、管理全州科技成果、科技獎勵、科技保密、科技檔案、技術市場、與科技相關的智慧財產權保護等工作，推動海西科教興州戰略的實施。
