海洋纖毛蟲具溝急游蟲的基因組重組過程與進化探討

《海洋纖毛蟲具溝急游蟲的基因組重組過程與進化探討》是依託中國海洋大學,由高鳳擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:海洋纖毛蟲具溝急游蟲的基因組重組過程與進化探討
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:高鳳
  • 依託單位:中國海洋大學
中文摘要,結題摘要,

中文摘要

纖毛蟲的基因組進化由其獨特的兩型核來演繹和完成。由於其類群間大核倍性的高度差異,大小核間的重組模式呈現高度的分化。圍繞此過程和機理的研究對於了解物種形成和分化具有重要的理論意義並因此成為國際間相關領域的研究熱點。當前的問題是:有關纖毛蟲基因重組模式與機制的研究仍在探索階段且僅來自極少數低等分化的淡水種類,因此在分化程度更高的尤其海洋類群中和更深入的工作亟待開展。本項目擬以海洋纖毛蟲--具溝急游蟲為材料,在轉錄組測序、分析的基礎上,開展下列探討:1、刻畫基因亂序在海洋纖毛蟲等高等寡毛類中的特徵、基因家族的命運、多倍性形成等具普遍性和不明的問題;2、揭示染色體斷裂位點特徵、內部切除序列與大核注定序列的關係,闡述大小核基因組的重組模式; 3、結合轉錄組信息,探討纖毛蟲不同類群中基因組的進化關係。該工作將為探討纖毛蟲物種分化-形成機理提供重要的資訊,同時也為纖毛蟲遺傳調控機制的深入研究奠定基礎。

結題摘要

本項目3年來以旋唇綱纖毛蟲等主要代表類群為實驗材料,對其基因組重組、rDNA多態性及拷貝數、形態分類、系統關係重建等開展了系統的研究。主要成果包括:1、急游蟲、檸檬類瘦尾蟲、黃色偽角毛蟲、大彈跳蟲的a-tubulin、Actin、TBP、ABC轉運蛋白等基因的大小核重組研究,為纖毛蟲乃至其他真核生物基因組進化研究提供了有價值的參考;2、完成了50餘種纖毛蟲單細胞rDNA拷貝數的測定和20餘種rDNA多態性的測定,對基於rDNA的分子系統學、分子生態學、物種鑑定、條形碼研究等提供了重要的參考資料;3、基於SSU-rDNA、ITS-5.8S和LSU-rDNA等多基因信息及二級結構分析,結合形態學、發生學對旋唇綱尾柱類的系統關係進行了梳理和重建;4、完成了對7屬16種纖毛蟲的鑑定和描述工作, DNA建庫以及不詳屬種的重厘定、重定義、纖毛圖式資料的補足等;5、海洋尾絲蟲的無菌培養及液氮凍存技術的摸索,為其他纖毛蟲培養提供了參考。以上成果在國際主流刊物發表文章9篇,9人次參加國際國內學術會議並做口頭或者牆報報告。

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