基本介紹
個人履歷,研究方向,代表論文,
個人履歷
男，1965年7月生，浙江湖州市人。1987年畢業於國防科學技術大學材料系，1987年9月至1992年7月在航天工業部一六五廠工作任工程師；1995年碩士畢業於西安交通大學大學電子工程系，1995年9月進入復旦大學物理學系學習，獲得理學博士學位 ，同年進入中國科學院上海藥物研究所博士後流動站從事藥物設計研究。2000年出站留所工作 ，任副研究員、研究員、博士生導師、課題組長。2005年1月被聘為華東理工大學藥學院特聘教授。
沈建華研究員的研究領域涉及藥物設計、計算分子生物物理化學和格線高性能計算技術。已在 JACS、JMB、Biophys. J等SCI雜誌上發表論文20餘篇，申請專利5項。先後承擔5項國家、上海市基金項目，包括國家“863”高科技基金項目、國家自然科學基金項目、上海市青年科技啟明星基金項目和上海市抗非典專項科研基金項目等。獲得2000年中法Servier青年藥物化學獎、2003年度上海科技進步一等獎和2003年上海市“優秀專業技術人才”稱號。
研究方向
針對脂質代謝疾病的藥物設計：
以 RXR異源二聚的核受體PPAR、LXR、FXR為靶標蛋白，利用計算機藥物設計技術結合實驗研究，設計出多靶標作用的活性化合物結構。然後，通過研究藥物的作用途徑，以期發現組織特異的具有調節血脂、膽固醇和增加胰島素敏感的藥物先導化合物。
針對 SARS CoV病毒 半胱氨酸蛋白酶的抑制劑設計：
通過模建 SARS CoV病毒 半胱氨酸蛋白酶的3維結構，利用高性能並行計算，虛擬篩選多個化合物或藥物分子資料庫，發現具有不可逆結合的半胱氨酸蛋白酶抑制活性的化合物，然後通過蛋白－化合物結合測試、化合物抑制酶水解活性測試以及化合物治療和保護SARS病毒感染細胞實驗，發現和確證抗SARS病毒藥物 先導化合物。
生物醫藥複雜分子體系的分子動力學研究：
套用分子動力學方法模擬包括 HIV逆轉錄酶、3CL 蛋白酶、核受體等蛋白質構像運動，從結構和運動出發闡明其功能的實現過程；改進靶向分子動力學方法，模擬藥物與靶標蛋白（如Hupzine A與乙醯膽鹼酯酶）的結合和解離過程、以及蛋白與蛋白的相互作用（如脂結合蛋白與核受體）過程，從動態水平上揭示相互作用的分子機理；採用Car－Parrnello分子動力學模擬，從量子力學水平研究質子在生物環境中運動特徵。
格線計算技術研究：
整合異地、異構的高性能計算資源，集成和最佳化多種藥物設計軟體，設計新藥研究套用格線方案，開發套用格線界面和相關中間軟體，建立新藥研究套用格線並納入國家格線工程，提供新藥虛擬篩選的格線計算服務。
代表論文
Yechun Xu, Jianhua Shen* , et al., How Does Huperzine A Enter and Leave the Binding Gorge of Acetylcholinesterase? Steered Molecular Dynamics Simulations J. AM. CHEM. SOC . ( 2003) 125, 11340-11349.
Jianhua Shen, et al., Virtual Screening on Natural Products for Discovering Active Compounds and Target Information, Current Medicinal Chemistry , ( 2003) 10, 2327-2342.
Lingling Shen, Jianhua Shen* , et al. Biophys. Journal, (2003) 84 ， 1-17. Steered Molecular Dynamics Simulation on the Binding of NNRTI to HIV-1 RT.
Xiaoqin Huang, Jianhua Shen* , et al., Biophysical Journal , (2003) 84, 171-184. Molecular Dynamics Simulations on SDF -1a : Binding with CXCR4 Receptor
Jianhua Shen ， Hualiang Jiang and Kaixian Chen, “Molecular Simulation and Design in Drug Discovery”, Jun. 2002, Edinburg , The BBSRC/CNCBD Workshop on E-science.
Feng Cheng, Jianhua Shen* et al., Biophysical Journal, (2002) 83, 753-762. Steered Molecular Dynamics Simulations on the “Tail Helix Latch” Hypothesis in the Gelsolin Activation Process
Meng Cui, Jianhua Shen*, et al., J. Mol. Biol. , (2002) 318, 417-428. Brownian dynamics simulations of the recognition of the Scorpion toxin P05 with the small-conductance Calcium-activated potassium channels.
