基本介紹
- 中文名：汪國華
- 國籍：中國
- 職業：教師
- 畢業院校：哈爾濱工業大學
- 學位/學歷：博士
- 專業方向：計算機套用技術
- 職務：哈工大計算機學院博士生導師
- 發表論文數量：39篇（截至2019年7月）
個人資料,工作經歷,教育經歷,研究方向,科研經歷,主要任職,表彰經歷,學術論文,
個人資料
汪國華，現任哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院教授、博士生導師，2013年度當選教育部“新世紀優秀人才支持計畫”，主持多項國家自然科學基金、國家863項目等。2008年以來在國內外重要生物信息學期刊發表多篇SCI檢索國際期刊論文。
工作經歷
2016年12月--，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，長聘教授
2014年12月--，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，教授
2013年4月--，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，博士生導師
2009年9月至2014年12月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，副教授
2004年7月至2009年9月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，講師
1999年7月至2004年7月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，助教
教育經歷
2014年3月至2016年4月，美國約翰霍普金斯大學博士後
2006年11月至2008年11月，美國印地安那大學-普渡大學印第安納波利斯分校訪問學者
2003年9月至2009年9月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，獲工學博士學位
2001年9月至2003年7月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，獲工學碩士學位
1995年9月至1999年7月，哈爾濱工業大學計算機科學與技術學院，獲工學學士學位
研究方向
生物信息學： DNA 甲基化與轉錄因子相互關係；等位基因上基因表達調控模型等。
生物醫學大數據：大規模基因組數據組裝，比對分析；單細胞測序數據分析；基因組與臨床數據相結合與轉化研究。
生物醫學人工智慧：基於人工智慧方法的藥物設計，生物醫學圖像分析與推理。
生物醫學大數據：大規模基因組數據組裝，比對分析；單細胞測序數據分析；基因組與臨床數據相結合與轉化研究。
生物醫學人工智慧：基於人工智慧方法的藥物設計，生物醫學圖像分析與推理。
科研經歷
1. 國家自然科學基金面上項目“結合甲基化 DNA 的轉錄因子識別及其調控功能研究”，2018.1-2021.12
2. 國家自然科學基金面上項目“基於個體基因組單核苷酸突變的等位基因轉錄調控模型研究”，2014.1-2017.12
3. 哈工大基礎研究傑出人才培育計畫“面向高通量數據的生物信息學方法研究”，2014.7-2016.7
4. 國家863項目“轉化醫學生物信息技術及產品研發”，2012.1-2015.12
5. 教育部新世紀人才計畫“面向個人基因組的生物信息學問題研究”，2014.1-2016.12
6. 博士後國際交流計畫派出項目“基因組中DNA甲基化對疾病調控機制研究”，2014.4-2016.4
7. 中國博士後科學基金第五批特別資助“基於單核苷酸突變的等位基因轉錄調控模型研究”，2012.6-2014.12
8. 第 49 批博士後基金面上項目“基於新一代測序數據的選擇性啟動子預測及分析”，2011.3-2013.3
9. 國家自然科學基金青年項目“基於CHIP-SEQ數據的microRNA啟動子區域預測及轉錄因子結合位點分析，2009.1-2012.12
10. 黑龍江省歸國留學基金項目“基於微陣列數據的轉錄因子與microRNA調控功能研究”負責人，2009.1-2012.12
11. 國家863項目“基於微陣列數據的miRNA調控機制分析的關鍵方法與技術（項目編號2007AA02Z302）”副組長
主要任職
1. 哈爾濱工業大學計算機學院生物信息技術教研室副主任
2.國際期刊《ISRN Genomics》期刊編委
3.12th International Conference on Bioinformatics of the Asia-Pacific Bioinformatics Network（InCoB2013）和12th Asia-Pacific Bioinformatics Conference（APBC2014）國際會議程式委員會成員
4.美國科學促進會( The American Association for the Advancement of Science ，AAAS )會員
5.中國計算機學會 (CCF) 高級會員，生物信息學專委委員，中國人工智慧學會會員
6.中國計算機學會CCF YOCSEF哈爾濱分論壇學術委員
7.《BMC Genomics》期刊 Associate Editor
8.《Biomedical research international》期刊特約編輯
9. InCoB2013、 APBC2014、 APBC2015、 ISBRA2018 國際會議程式委員會成員
10.《BMC Genomics》、《BMC System Biology》、《Current Bioinformatics》和《Computational and Mathematical Methods in Medicine》和《Oncotarget》等生物信息學期刊審稿人
表彰經歷
2013 年，教育部“新世紀優秀人才支持計畫”
2011 年，中國計算機學會“2011CCF 優秀博士學位論文獎提名”
2011 年，哈爾濱工業大學十三屆優秀博士學位論文
2011 年，第十二屆黑龍江省自然科學技術學術成果獎二等獎
2009 年，文章“Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates microRNA transcription in interferongamma-stimulated HeLa cells”在國際會議“Critical Assessment of Massive Data Analysis 2009” (CAMDA 2009)上獲得唯一獎項“Best Presentation Award”
2011 年，中國計算機學會“2011CCF 優秀博士學位論文獎提名”
2011 年，哈爾濱工業大學十三屆優秀博士學位論文
2011 年，第十二屆黑龍江省自然科學技術學術成果獎二等獎
2009 年，文章“Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates microRNA transcription in interferongamma-stimulated HeLa cells”在國際會議“Critical Assessment of Massive Data Analysis 2009” (CAMDA 2009)上獲得唯一獎項“Best Presentation Award”
學術論文
SCI檢索索引國際期刊：
1. Zhu H, Wang G, Qian J. Transcription factors as readers and effectors of DNA methylation. Nature Review Genetics. 2016;17(9):551-65 (影響因子： 40.282，中科院一區，他引： 35)
2. White DT#, Eroglu AU#, Wang G#, Zhang L, Sengupta S, Ding D, Rajpurohit SK, Walker SL, Ji H, Qian J, Mumm JS. ARQiv-HTS, a versatile whole-organism screening platform enabling in vivo drug discovery at high-throughput rates. Nature Protocol. 2016 Dec;11(12):2432-2453 (並列第一作者，影響因子： 10.032 ，中科院一區，他引： 4)
3. Wang G*, Luo X, Wang J, Wan J, Xia S, Zhu H, Qian J, Wang Y. MeDReaders: a database for transcription factors that bind to methylated DNA. Nucleic Acids Res. 2018;46(D1):D146-D151 (影響因子： 10.162，中科院一區)
4. Zou Q, Hu Q, Guo M, Wang G*. HAlign: Fast multiple similar DNA/RNA sequence alignment based on the centre star strategy. Bioinformatics. 2015 Aug 1;31(15):2475-81 (影響因子： 7.307，中科院一區，熱點論文，他引： 39)
5. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Collins NR, Thomson MJ, Geistlinger TR, Carroll JS, Brown M, Hammond S, Srour EF, Liu Y, Nakshatri H. Estradiol-regulated microRNAs control estradiol response in breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 2009; 37(14):4850-4861 (影響因子： 7.836，中科院一區，他引： 168)
6. Liu Y#, Balaraman Y#, Wang G#, Nephew KP, Zhou FC. Alcohol exposure alters DNA methylation profiles in mouse embryos at early neurulation. Epigenetics. 2009; 4(7):500-511. (並列第一作者，影響因子： 4.584，中科院二區，他引： 113)
7. Wang Y#, Wang G#, Yang B, Tao H, Yang JY, Deng Y, Liu Y. Reconstruct gene regulatory network using slice pattern model. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S2. (co-first author) (並列第一作者，影響因子：4.206，中科院二區，他引：1)
8. Wang G, Wang Y, Feng W, Wang X, Yang JY, Zhao Y, Wang Y, Liu Y. Transcription factor and microRNA regulation in androgen-dependent and -independent prostate cancer cells. BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 2:S22 (影響因子： 3.759，中科院二區，他引： 30)
9. Wang G, Wang X, Wang Y, Yang JY, Li L, Nephew KP, Edenberg HJ, Zhou FC, Liu Y. Identification of transcription factor and microRNA binding sites in responsible to fetal alcohol syndrome. BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S19 (影響因子： 3.759，中科院二區，他引： 11)
10. Bhat-Nakshatri P, Wang G, Appaiah H, Luktuke N, Carroll JS, Geistlinger TR, Brown M, Badve S, Liu Y, Nakshatri H. AKT alters genome-wide estrogen receptor alpha binding and impacts estrogen signaling in breast cancer. Mol Cell Biol. 2008; 28(24):7487-7503 (影響因子：6.057，中科院二區，他引： 40)
11. Wang G*, Wang F, Huang Q, Li Y, Liu Y, Wang Y. Understanding Transcription Factor Regulation by Integrating Gene Expression and DNase I Hypersensitive Sites. Biomed Res Int. 2015;2015:757530 (影響因子： 2.476，中科院三區)
12. Wang G*, Liu Y, Zhu D, Klau GW, Feng W. Bioinformatics Methods and Biological Interpretation for Next-Generation Sequencing Data. Biomed Res Int. 2015; 2015:690873 (影響因子： 2.476，中科院三區)
13. Zhao Y, Zou Q; Jiang Y; Wang, G*. A Graphic Processing Unit Web Server for Computing Correlation Coefficients for Gene Expression Data. Journal of Computational and Theoretical Nanoscience, 12(4), pp 582-584 (影響因子： 1.666，中科院三區)
14. Wang G*, Qi K, Zhao Y, Li Y, Juan L, Teng M, Li L, Liu Y, Wang Y. Identification of Regulatory Regions of Bidirectional Genes in Cervical Cancer. BMC Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S5 (影響因子： 2.873，中科院三區，他引： 8)
15. Wang G, Wang Y, Shen C, Huang Y, Kuang K, Huang T, Nephew K, Li L, Liu Y. RNA Polymerase II binding patterns reveal genomic regions involved in microRNA gene regulation. PLoS ONE. 2010;5(11): e13798 (影響因子： 4.092，中科院三區，他引： 27)
16. Wang G, Wang Y, Teng M, Zhang D, Li L, Liu Y. Signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) regulates microRNA transcription in interferon γ – stimulated HeLa cells. PLoS ONE. 2010; 5(7):e11794 (影響因子： 4.092，中科院三區，他引： 9)
17. Zou Q, Li X, Jiang Y, Zhao Y, Wang G*. BinMemPredict: a Web server and software for predicting membrane protein types. Current Proteomics. 2013; 10(1): 2-9 (影響因子： 0.635， 他引：23，中科院四區)
18. Qu K, Han K, Wu S, Wang G, Wei L. Identification of DNA-Binding Proteins Using Mixed Feature Representation Methods. Molecules. 2017 Sep 22;22(10) (影響因子： 2.861，中科院三區)
19. Liu S, Zibetti C, Wan J, Wang G, Blackshaw S, Qian J. Assessing the model transferability for prediction of transcription factor binding sites based on chromatin accessibility. BMC Bioinformatics. 2017 Jul 27;18(1):355 (影響因子： 2.448，中科院二區)
20. Zhao Y, Wang F, Chen S, Wan J, Wang G. Methods of MicroRNA Promoter Prediction and Transcription Factor Mediated Regulatory Network. Biomed Res Int. 2017;2017:7049406 (影響因子：影響因子： 2.476，中科院三區)
21. Peng J, Bai K, Shang X, Wang G, Xue H, Jin S, Cheng L, Wang Y, Chen J. Predicting disease-related genes using integrated biomedical networks. BMC Genomics. 2017 Jan 25;18(Suppl 1):1043 (影響因子： 3.729，中科院二區，高被引論文，他引： 6)
22. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Zimmer-Galler I, Shah SM, Wenick AS, Brady CJ, Han I, He L, Channa R, Poon D, Meyerle C, Aronow MB, Sodhi A, Handa JT, Kherani S, Han Y, Sophie R, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors in Diabetic Macular Edema; the Diabetic Macular Edema Treated With Ozurdex Trial. Am J Ophthalmol. 2016;168:13-23(影響因子： 5.052，中科院二區)
23. Zou Q, Li J, Song L, Zeng X, Wang G. Similarity computation strategies in the microRNA-disease network: a survey. Brief Funct Genomics. 2015 Jul 1. pii: elv024 (影響因子： 4.098，中科院二區，高被引論文，他引： 51)
24. Oliver VF, Jaffe AE, Song J, Wang G, Zhang P, Branham KE, Swaroop A, Eberhart CG, Zack DJ, Qian J, Merbs SL. Differential DNA methylation identified in the blood and retina of AMD patients. Epigenetics. 2015;10(8):698-707 (影響因子： 4.394，中科院二區，他引： 8)
25. Wan J, Oliver VF, Wang G, Zhu H, Zack DJ, Merbs SL, Qian J. Characterization of tissue-specific differential DNA methylation suggests distinct modes of positive and negative gene expression regulation. BMC Genomics. 2015 Feb 5;16:49 (影響因子： 3.729，中科院二區，他引： 30)
26. Campochiaro PA, Hafiz G, Mir TA, Scott AW, Sophie R, Shah SM, Ying HS, Lu L, Chen C, Campbell JP, Kherani S, Zimmer-Galler I, Wenick A, Han I, Paulus Y, Sodhi A, Wang G, Qian J. Pro-permeability Factors After Dexamethasone Implant in Retinal Vein Occlusion; The Ozurdex for Retinal Vein Occlusion (ORVO) Study. Am J Ophthalmol. 2015 Oct 16. pii: S0002-9394(15)00604-2 (影響因子： 5.052，中科院二區，他引： 6)
27. Zhang D, Wang G, Wang Y. Transcriptional regulation prediction of antiestrogen resistance in breast cancer based on RNA polymerase II binding data. BMC Bioinformatics. 2014;15 Suppl 2:S10 (影響因子： 2.435，中科院二區，他引： 1)
28. Zhu S, Wang G, Liu B, Wang Y. Modeling exon expression using histone modifications. PLoS ONE. 2013; 8(6): e67448 (影響因子： 3.234，中科院三區，他引： 4)
29. Cheng L, Wang G, Li J, Zhang T, Xu P, Wang Y. SIDD: A Semantically Integrated Database towards a Global View of Human Disease. PLoS One. 2013;8(10):e75504 (影響因子： 3.234，中科院三區，他引： 10)
30. Jiang Q, Wang G, S Jin, Y Li, Wang Y*. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 2013; 8(3):282-293 (影響因子： 0.495，他引： 22，中科院四區)
31. Juan L, Wang G, Radovich M, Schneider BP, Clare SE, Wang Y, Liu Y. Potential roles of microRNAs in regulating long intergenic noncoding RNAs. BMC Medical Genomics. 2013;6 Suppl 1:S7 (影響因子： 2.873，中科院三區，他引： 40)
32. Teng M, Wang Y, Kim S, Li L, Shen C, Wang G, Liu Y, Huang T, Nephew KP, Balch C. Empirical Bayes model comparisons for differential methylation analysis. Comparative and Functional Genomics, 2012:376706 ( 影響因子： 1.747，中科院四區，他引： 1)
33. Zhu S, Jiang Q, Wang G, Liu B, Teng M, Wang Y. Chromatin structure characteristics of pre-miRNA genomic sequences. BMC Genomics. 2011 Jun 25;12:329 (影響因子： 4.397，中科院二區，他引： 5)
34. Shen C, Huang Y, Liu Y, Wang G, Zhao Y, Wang Z, Teng M, Wang Y, Flockhart DA, Skaar TC, Yan P, Nephew KP, Huang TH, Li L. A modulated Empirical Bayes Model for Identifying Topological and Temporal Estrogen Receptor alpha Regulatory Networks in Breast Cancer. BMC Syst Biol. 2011;5(1):67 (影響因子： 2.982，中科院二區，他引： 16)
35. Patel JB, Appaiah HN, Burnett RM, Bhat-Nakshatri P, Wang G, Mehta R, Badve S, Thomson MJ, Hammond S, Steeg P, Liu Y, Nakshatri H. Control of EVI-1 oncogene expression in metastatic breast cancer cells through microRNA miR-22. Oncogene. 2011; 30(11):1290-1301 (影響因子：7.357，中科院一區，他引： 63)
36. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Juan L, Zhang T, Teng M, Liu Y, Wang Y. Prioritization of disease microRNAs through a human phenome-microRNAome network. BMC Syst Biol. 2010; 4 Suppl 1:S2 (影響因子： 3.148，中科院二區，他引： 90)
37. Wang X, Wang K, Radovich M, Wang Y, Wang G, Feng W, Sanford JR, Liu Y. Genome-wide prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific pre-mRNA alternative splicing. BMC Genomics. 2009; 10 Suppl 1:S4 (影響因子： 4.206，中科院二區，他引： 8)
38. Jiang Q, Wang Y, Hao Y, Juan L, Teng M, Zhang X, Li M, Wang G, Liu Y. miR2Disease: a manually curated database for microRNA deregulation in human disease. Nucleic Acids Res. 2009; 37(Database issue):D98-104 (影響因子： 7.836，中科院一區，高被引論文，他引： 494 )
39. Wang X, Wang G, Shen C, Li L, Wang X, Mooney SD, Edenberg HJ, Sanford JR, Liu Y. Using RNase sequence specificity to refine the identification of RNA-protein binding regions. BMC Genomics. 2008; 9 Suppl 1:S17 (影響因子： 3.759，中科院二區，他引： 6)
其它國際期刊及會議文章：
40. Teng M, Wang Y, Wang G, Jung J, Edenberg H, Sanford J, Liu Y. Prioritizing single-nucleotide variations that potentially regulate alternative splicing. BMC Proceedings, 2011; 5(Suppl 9):S40.
41. Jiang Q, Wang G, Wang Y. An approach for prioritizing disease-related microRNAs based on genomic data integration. The 3rd International Conference on BioMedical Engineering and Informatics (BMEI'10). 2010. p2270-2274 (EI 檢索)
42. Jiang Q, Wang G, Zhang T, Wang Y. Predicting human microRNA-disease associations based on support vector machine. 2010 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM'10). 2010. p467-472
43. Jiang Q, Hao Y, Wang G, Zhang T, Wang Y. Weighted network-based inference of human microRNA-disease associations. The 5th International Conference on Frontier of Computer Science and Technology. 2010. p431-435 (EI 檢索)
44. Wang X, Teng M, Wang G, Zhao Y, Han X, Feng W, Li L, Sanford J, Liu Y, xIP-seq platform: an integrative framework for high-throughput sequencing data analysis. 2009 Ohio Collaborative Conference on Bioinformatics, OCCBIO 2009. p26-31 (EI 檢索)
45. Wang X, Wang K, Wang G, Sanford J, Liu Y. Model-based prediction of cis-acting RNA elements regulating tissue-specific alternative splicing. 8th IEEE International Conference on BioInformatics and BioEngineering, BIBE 2008. p1-6 (EI 檢索)
46. Chen AB, Hamamura K, Wang G, Xing W, Mohan S, Yokota H, Liu Y. Model-based comparative prediction of transcription-factor binding motifs in anabolic responses in bone. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2007; 5(3-4):158-165.
47. Guo-hua Wang, Ya-Dong Wang, Mao-Zu Guo. An ontology-based method for similarity calculating between concepts in the semantic web. Proceedings of the fifth International Conference on Machine Learning and Cybernetics 2006. p1538-1542 (EI 檢索)
