江蘇省區域現代農業與環境保護協同創新中心於2013年4月經江蘇省人民政府批准為培育建設的江蘇高校協同創新中心，2014年3月經江蘇省人民政府批准，正式立項為江蘇省高校協同創新中心。本中心緊密圍繞糧食安全和環境保護國家戰略，面向洪澤湖區域現代農業發展與湖泊環境保護的地方需求，在“環洪澤湖農業種質資源保護與創新”、“農業優質高效安全生產技術”、“洪澤湖漁業資源保護與健康養殖”、“生物質資源綜合利用技術”、“湖泊水體污染監控與生態修復”、“農業資源利用與農業區劃”等6個方面開展協同攻關，取得一批重大標誌性成果，支撐我省創新型省份建設。
中心匯聚了國家農業科技園區、省級重點實驗室等一批具有先進水平的國家、省部級基地和平台，儀器設備總值1.8億元以上，大型儀器設備均高度開放。協同創新中心現有科研人員130名，其中中科院院士1名、國家傑青5名、“千人計畫”1名、中科院“百人計畫”3名；“環洪澤湖區域植物種質資源創新與綜合利用”團隊為江蘇高校“青藍工程”科技創新團隊，“生態農業技術”團隊於2013年入選江蘇高校優秀科技創新團隊。
中心組建以來，已形成了一批代表性成果，有效推動了地方經濟發展和生態文明建設。如繼“抗條紋葉枯病高產優質粳稻新品種選育及套用”與“矮敗小麥及其高效育種方法的創建與套用”於2011年同時獲國家科技進步一等獎之後，選育的小麥新品種“淮麥33”於2013年被江蘇明天種業以1033萬元高價買斷獨家全國經營權；“環洪澤湖高標準糧田地力提升技術集成與推廣”成果有效降低了農業面源污染、保護了洪澤湖生態環境，於2013年10月獲農業部全國農牧漁業豐收獎。
