水路運輸企業利潤是水路運輸企業在一定時期內經營旅客和貨物運輸、裝卸、堆存業務，銷售業務以及其他業務所取得的財務成果。其利潤總額由營運利潤 (從事客貨運輸、裝卸、堆存業務的利潤) 銷售利潤 (銷售產品、材料、燃料或提供勞務的利潤)、營業外收入 (旅客保險收入、修船拆件變價收入 沒收包裝物押金收入) 減營業外支出 (除與工業企業營業外支出的相同項目外，還包括防疫費用、公安費用、海事法院費用) 的淨值三部分構成。
為了反映企業實現的利潤總額，應設定“利潤”帳戶組織總分類核算。在該帳戶下，按利潤種類，分別設定“運輸利潤”、“裝卸利潤”、“堆存利潤”、“代理業務利潤”、“銷售利潤”、“其他業務利潤”、“營業外收入”、“營業外支出”等帳戶組織明細分類核算。所實現的利潤貸記該帳戶，發生的虧損借記入該帳戶。年末通過利潤分配、該帳戶應無餘額。
