武漢大學水安全研究院於2012年成立，以水資源、水生態環境系統與社會經濟發展和資源開發利用為紐帶，在水資源、水生態環境學科發展前沿和重大水利水電和生態環境保護治理工程建設套用研究領域，提出水資源開發與流域綜合調度管理戰略、流域水生態環境保護戰略和水旱災害防治戰略，取得一批具有創新性、實用性和自主智慧財產權的標誌性成果，為加速我國水污染與水旱災害的綜合治理和重大水利水電與節能減排工程建設，滿足經濟建設與社會發展對水資源、水環境與水生態的需求，保障水安全、能源安全和生態環境安全，實現社會經濟可持續發展，提供理論與技術支持。
武漢大學水安全研究院設立水資源規劃與管理、水旱災害防治與氣候變化、水環境與水污染控制、水生態維持與修復、水安全保障政策共五個研究方向。
