《機動警察劇場版3廢棄物13號》是由高山文彥、遠藤卓司執導,田中敦子、平田廣明、綿引勝彥主演的電影。
一架隸屬於美國的運輸機墜落到東京灣,恐怖的經歷就此展開..數日後,接連發生的機器人被襲擊案件導致數名駕駛員的死亡,刑事久住武史和助手泰真一郎開始調查此案。在調查過程中,心不在焉的一郎認識了岬?子,對她產生了愛慕。襲擊事件仍舊繼續發生著,不僅是機器人,連普通人也有數人死於非命,而且在東京灣內,漁民發現了巨大的不明物體。在得知巴比倫基地發生怪異事件後,兩位刑事趕到基地,卻被一隻巨大的怪物追擊而險些喪命。此時,東都生物醫學研究所的所長似乎知道整件事情的來龍去脈,而久住武史和泰真一郎也追查到了這裡,他們發現岬?子原來是這裡的研究員,她的可疑之處頗多,而一郎也了解到?子悲慘的過去。經過努力,案情基本得到確認:怪物是實驗室的樣品,代號是“13號”。為了消滅怪物,各方決定協同作戰,並由特車2課第2小隊實行消滅任務!當13號落入圈套時,?子也選擇了結束生命,而一郎卻無法阻止這一切的發生......