榆林市新型農村合作醫療管理辦公室成立於2008年11月21日，為市新農合工作協調領導小組日常辦事機構，是新農合市級統籌的實施機構。原掛靠在市衛生局農衛科。2011年度根據榆編辦[2011]175號檔案，經市編委核定為副縣級全額事業單位，編制15人，隸屬市衛生局管理。內設業務稽查科、綜合科、網路信息科、基金管理科四個科室。主要職責為組織實施全市新農合工作，制訂新農合管理辦法和補償方案；審定全市新農合定點醫療機構，並對各縣區合療辦和定點醫療機構進行綜合管理和監督檢查。
