《格特隱球菌MAT位點的重組分析》是依託上海交通大學，由馮曉博擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：格特隱球菌MAT位點的重組分析
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：馮曉博
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
遺傳學分析表明，導致加拿大溫哥華島及周邊區域暴發格特隱球菌病的強毒力株VGIIa基因型很可能由同性交配產生；2005年，實驗室條件下，已成功構建了新生隱球菌α-α菌株間的同性交配模型；最近，α二倍體菌株的發現被認為是同性交配中產生的中間態。直到目前為止，仍然沒有發現隱球菌環境株或臨床株中存在同性交配現象的直接證據。最近，通過基因組多位點遺傳學分析，我們研究發現，交配型（MAT）位點內基因存在基因系譜的不一致性，提示同性交配可能。本研究擬通過對格特隱球菌交配型（MAT）位點及周圍區域，以及全基因組的AFLP分析，對數據進行同質性檢驗等分析，通過評價樹的一致性以及位點間的連鎖不平衡來進一步闡明受試株間的遺傳重組是否確由同性交配產生，在格特隱球菌臨床和環境中尋找同性交配的直接證據，為研究格特隱球菌的致病機制打下基礎。
結題摘要
新生和格特隱球菌是導致人類發生致命感染的病原真菌，由其所致感染可表現為腦膜腦炎、肺炎及皮膚感染等。新生隱球菌包括格魯比變種、新生變種及兩者間的雜合子AD型。新生隱球菌、格特隱球菌及變種、交配型間的準確鑑定對於後期研究及臨床套用都十分重要。近年報導，格特隱球菌分布範圍在逐步擴大。遺傳學研究顯示，導致1999年至今在加拿大溫哥華島及周邊區域暴發格特隱球菌病的強毒力株VGIIa基因型很可能由同性交配產生。由於核基因組中多位點的遺傳分析和群體遺傳學研究常被用於分析真菌同源重組的發生，我們擬通過對交配型（MAT）位點及周圍區域進行分析，對數據進行同質性檢驗、關聯繫數等分析。通過評價樹的一致性以及位點間的連鎖不平衡來闡明受試株間的遺傳重組及是否確由同性交配產生。因此，本研究分為兩部分：（1）新生隱球菌、格特隱球菌及變種、交配型間的準確和快速鑑定；（2）對於準確鑑定的格特隱球菌及其相應交配型進行下一步的多位點序列及遺傳重組分析。完成情況如下，建立了高致病性、暴發流行株格特隱球菌VGII/AFLP6基因型的快速鑑定及序列分型研究；建立蘇子種培養基用於新生和格特隱球菌的快速和簡便鑑定；建立新生隱球菌格魯比變種、新生變種和格特隱球菌的的多重PCR鑑定；分析新生和格特隱球菌基因組中的內含子缺失及套用於快速鑑定中；格特隱球菌交配型的多重PCR鑑定；對鑑定準確的格特隱球菌及其交配型進行核基因、交配型位點和線粒體基因的序列和重組分析。多位點的序列和系統發育分析結契約質性檢驗表明，受試位點中，僅ATP6位點發現格特隱球菌VGI和VGII菌株間基因的雜交和重組，該基因系譜與其餘位點的基因系譜呈現不一致性。結果表明，VGI和VGII菌株間線粒體基因的重組；沒有發現核基因及交配型位點中2者間的重組，提示VGI和VGII菌株間線粒體基因的重組現象與交配行為無關。相關成果發表於《J Clin Microbiol》等醫學微生物領域權威期刊。總計發表SCI論文5篇，核心期刊3篇(接受1篇)，獲得發明專利1項。
