《核酸適配體手冊》是化學工業出版社出版的圖書。
基本介紹
- 中文名：核酸適配體手冊
- 出版時間：2013年10月1日
- 出版社：化學工業出版社
- 頁數：427 頁
- ISBN：9787122179807
- 定價：128.00 元
- 裝幀：精裝
內容簡介,圖書目錄,
內容簡介
《核酸適配體手冊》全書圍繞功能性寡核苷酸及其套用，系統介紹了核酸適配體的體外篩選原理、技術方法以及近年來在基礎醫學、臨床診斷、藥物研究等方面的套用。主要包括各種靶分子的適配體體外篩選技術；用核酸適配體作為藥理探針在體內和體外確定靶標、蛋白功能分析、活體成像和適配體在臨床治療研究中的套用等。書中內容均為該領域*研究成果，其介紹的內容和方法對於國內適配體研究工作者具有指導意義和良好參考價值。
圖書目錄
第1篇歷史和理論背景
第1章體外篩選功能性寡核苷酸及其生物化學活性的起源
James M.Carothers 和 Jack W.Szostak著；屈鋒 譯
1.1引言
1.2體外篩選的簡短歷史
1.3體外篩選產生適配體、核酶、脫氧核酶的啟示
1.4合成學方法用於理解功能核酸的自然起源
1.5的技術發展和未來的方向
1.6小結
致謝
參考文獻
第2章RNA進化的數學模型、計算機模擬和體外篩選的概念
Peter Schuster 著；宋丹丹 譯
2.1從早期的實驗和理論到中性網路的概念
2.1.1試管中的進化
2.1.2分子進化的動力學理論
2.1.3序列空間和形狀空間
2.2RNA結構、熱力學和動力學摺疊
2.2.1小自由能的二級結構
2.2.2逆摺疊
2.2.3次優構象與動力學摺疊
2.2.4共摺疊和DNA參數
2.3中性網路和計算機模擬分子進化
2.3.1序列空間中的中性網路
2.3.2計算機模擬RNA進化
2.3.3計算機模擬進化的經驗教訓
2.4設計的和天然的RNA開關
2.5RNA設計未來存在的問題展望
致謝
參考文獻
第3章適配體進化中的適應性曲面，錯誤閾值和輔助因子
.dám Kun，Marie.Christine Maurel，Mauro Santos and E.rs Szathmáry著；
宋丹丹 譯
3.1引言
3.2從實例中推導的函式曲面
3.2.1適應性曲面
3.2.2核酶參與的損傷篩選實驗
3.2.3適應性曲面的構建
3.2.4案例研究：脈孢菌VS核酶的適應性曲面
3.3從函式曲面推斷的錯誤閾值：脈孢菌VS核酶的“真實”錯誤閾值
3.4尋找催化的伴侶：輔助因子和適配體
3.4.1聯合.核酶（輔助因子輔助的核酶）
3.4.2適配體酶
3.5輔酶的運用：通過翻譯和遺傳密碼，從RNA世界到蛋白質世界
3.6展望
致謝
參考文獻
第2篇靶標結合的寡核苷酸的體外篩選
第4章小分子的適配體
Heiko Fickert，Iris G.Fransson和Ulrich Hahn 著；趙新穎 譯
4.1引言
4.2核苷酸、核苷和鹼基的適配體
4.3輔助因子的適配體
4.4胺基酸的適配體
4.5糖的適配體
4.6天然產物的適配體
4.7有機或螢光染料的適配體
4.8嵌合的適配體篩選方法
4.9小結
致謝
參考文獻
第5章抗生素的適配體
Christina Lorenz和Renée Schroeder 著；趙新穎 譯
5.1引言
5.2與RNA結合的抗生素
5.3四環素的適配體
5.4鏈黴素的適配體
5.5氨基糖苷的適配體
5.6氯黴素的適配體
5.7肽類抗生素紫黴素的適配體
5.7.1肽類抗生素紫黴素作為初始的前導分子
5.8從抗生素結合的適配體中我們學到了什麼？
致謝
參考文獻
第6章蛋白質的適配體
Shahid M.Nimjee，Christopher P.Rusconi and Bruce A.Sullenger 著；呂雪飛譯
6.1前言
6.2蛋白質抑制劑適配體的性質
6.3細胞因子/生長因子
6.3.1血管內皮生長因子（VEGF）
6.3.2人干擾素γ
6.3.3血管生成素.
6.3.4鹼性成纖維細胞生長因子
6.3.5血小板衍生生長因子
6.4核酸結合蛋白
6.4.1HIV.1 Tat
6.4.2HIV.1 Rev
6.4.3HIV反轉錄酶
6.4.4轉錄因子 E2F
6.4.5核因子 Kappa B
6.5絲氨酸蛋白酶
6.5.1C型肝炎病毒.NS3（HSV.NS3）
6.5.2人嗜中性粒細胞彈性蛋白酶
6.5.3凝血酶
6.5.4Ⅶa因子
6.5.5Ⅸa因子
6.6抗體/免疫球蛋白
6.6.1抗胰島素受體的抗體MA
6.6.2乙醯膽鹼受體的單克隆抗體（MAb）
6.6.3免疫球蛋白E
6.6.4細胞毒性T細胞抗原
6.7細胞表面受體/細胞黏附分子
6.7.1P.選擇素
6.7.2L.選擇素
6.7.3前列腺特異性膜抗原
6.7.4克氏錐蟲
6.8補體蛋白——人補體C
6.9細胞外膜蛋白——肌腱蛋白C
6.10脂蛋白——人非胰腺分泌的磷脂酶A
6.11阮病毒蛋白——阮病毒蛋白PrPSc
6.12多肽類
6.12.1Ghrein/胃促生長素
6.12.2神經肽降鈣素基因相關肽
6.12.3促性腺激素釋放激素
6.12.4神經肽痛敏肽/孤啡肽FQ
6.13小結
參考文獻
第7章核酸結構的適配體
Jean.Jacques Toulmé，Fabien Darfeuille，Carmelo Di Primo 和 EricDausse 著；
呂雪飛 譯
7.1引言
7.2雙鏈核酸的適配體
7.3環.環間的相互作用
7.3.1RNA.RNA “親吻”複合物
7.3.2DNA.RNA“親吻”複合物
7.3.3雙RNA.RNA“親吻”環作用
7.3.4頂環.內環相互作用
7.4化學修飾的適配體識別RNA靶標
7.5基於核酸靶標的適配體的生物學特性
7.6小結
致謝
參考文獻
第8章核糖開關：天然的代謝物結合RNA調控基因表達
Adam Roth，Rüdiger Welz，Ronald R.Breaker 著；張小莉 譯
8.1引言
8.2核糖開關的基因調控
8.3核糖開關的適配體結合域
8.4特異性識別鳥嘌呤和腺嘌呤的天然適配體
8.5適配體結構的高分辨分析
8.6甘氨酸核糖開關
參考文獻
第3篇具有催化活性的短鏈寡核苷酸的體外篩選
第9章具有催化活性的RNA分子：有機化學中的工具
Barbara.Sylvia Weigand，Andreas Zerressen，J.rg C. Schlatterer，MarkHelm
和 Andres J.schke 著；高培峰 譯
9.1引言
9.2具有催化活性的生物大分子
9.3核酶的從頭構建
9.4核酶的催化譜
9.5小結
參考文獻
第10章脫氧核酶：具有催化活性的DNA分子
Kenny Schlosser，Simon A.McManus，Yingfu Li 著；屈鋒，高培峰 譯
10.1DNA催化能力的初證明
10.1.1剪下RNA的DNA核酶
10.1.2連線DNA的脫氧核酶
10.1.3催化卟啉金屬化的DNA
10.2兩種剪下RNA的脫氧核酶的故事
10.2.110.23和8.17的體外篩選及二級結構
10.2.210.23用於基因治療
10.2.310.23的其他用途
10.2.48.17的功用
10.2.5體外篩選實驗中8.17的重現
10.3其他的脫氧核酶
10.3.1其他剪下RNA的脫氧核酶
10.3.2催化RNA連線的脫氧核酶
10.3.3催化DNA剪下的DNA核酶
10.3.4修飾DNA的DNA核酶
10.3.5催化磷酸二酯鍵形成的DNA酶
10.3.6催化胸腺嘧啶二聚體修復的脫氧核酶
10.3.7具有外來功能的DNA酶
10.4展望
參考文獻
第4篇套用和展望
第11章核酸適配體作為藥理探針的體內外靶標確認
P.Shannon Pendergrast 和 David M.Epstein著；李玉娟 譯
11.1引言
11.2核酸適配體作為藥理探針用於靶標確認
11.3基因或mRNA敲除對靶標確認的限制
11.4核酸適配體用於靶標確認
11.4.1適配體用於細胞內靶標的體外確認
11.4.2適配體用於細胞內外靶標的體內確認
11.5小結
參考文獻
第12章用於蛋白功能分析和藥物發現的內配體
Michael Famulok 和 Günter Mayer著；屈鋒 譯
12.1引言
12.2內配體：細胞內的適配體
12.3適配體作為抑制劑篩選的探針
12.4小結
致謝
參考文獻
第13章適配體酶：別構核酶和脫氧核酶作為生物感測器
Scott M.Knudsen 和 Andrew D.Ellington 著；屈鋒 譯
13.1引言
13.1.1寡核苷酸依賴的適配體酶
13.1.2非核酸效應子的激活
13.2通過合理設計和體外篩選的方法創建適配體酶
13.2.1合理設計適配體酶
13.2.2體外適配體酶篩選
13.3效應子激活
13.4適配體酶結構和功能的多樣性
13.5生物學和生物技術套用中的適配體酶
13.5.1作為生物感測器的適配體酶
13.5.2適配體酶作為分子的邏輯門
13.5.3適配體酶陣列
13.5.4適配體酶的體內套用
致謝
參考文獻
第14章適配體轉化為小分子先導化合物
Andreas Jenne 著；李玉娟 譯
14.1引言
14.2合理的藥物設計
14.3生化篩選
14.4小結
致謝
參考文獻
第15章適配體作為配體在親和色譜和毛細管電泳中的套用
Eric Peyrin 著；趙新穎 譯
15.1引言
15.2親和液相色譜（和電色譜）中的配體
15.2.1親和色譜的一般原理
15.2.2蛋白質的分離/純化
15.2.3小分子的分離
15.2.4特定靶標的手性分離
15.3親和毛細管電泳中適配體作為配體
15.3.1親和毛細管電泳的一般原理
15.3.2親和毛細管電泳用於靶蛋白的定量分析
15.4小結
參考文獻
第16章用於體內成像的適配體
Sandra Borkowski 和 Ludger M.Dinkelborg 著；屈鋒，樂勝鋒 譯
16.1體內成像：模式和要求
16.1.1成像模式
16.1.2成像的要求
16.2體內成像用適配體
16.2.1體內套用的寡核苷酸性質
16.2.2不同類型的靶向試劑比較
16.2.3用於成像的適配體靶
16.3適配體的標記
16.3.1SPECT所用的同位素
16.3.2PET所用的同位素
16.4SPECT和PET成像中的寡核苷酸
16.4.1非靶向適配體
16.4.2反義寡核苷酸
16.4.3靶向適配體
16.5展望
參考文獻
第17章治療用適配體的性質
Sharon T.Cload，Thomas G.McCauley，Anthony D.Keefe，JudithM.Healy和
Charles Wilson著；李玉娟 譯
17.1引言
17.2適配體靶標
17.2.1細胞表面的靶標
17.2.2細胞內的靶標
17.2.3細胞外靶標
17.3適配體結合的特點
17.3.1適配體的親和性
17.3.2適配體的特異性
17.3.3適配體結合動力學
17.3.4結合與功能
17.4適配體的化學修飾
17.4.1 2′－修飾
17.4.2 3′－端加帽
17.4.3 5′－端加帽
17.4.4磷酸鹽取代
17.4.5鹼基修飾
17.4.6聚乙二醇
17.4.7脂質標籤
17.4.8肽標籤
17.5適配體的給藥途徑
17.5.1非腸道
17.5.2與生物製劑比較
17.6替代適配體製劑的機遇
17.6.1儲庫給藥
17.6.2局部給藥
17.6.3口服給藥
17.6.4肺部給藥
17.6.5眼部給藥
17.7適配體的藥物動力學和生物分布
17.7.1關鍵的藥物動力學和生物分布的參數
17.7.2控制適配體藥物動力學和代謝穩定性的因素
17.7.3適配體的生物分布
17.7.4適配體定量的生物分析方法
17.7.5適配體的藥物動力學和生物分布性質的總結
17.8適配體的毒性曲線
17.9適配體的免疫原性
17.10適配體的生產
17.10.1對適配體合成成本的貢獻
17.10.2生產設施
17.10.3化學合成與生物合成的優勢
17.11研發中的治療用適配體實例
17.11.1抗凝血酶適配體ARC1
17.11.2抗補體C5的適配體ARC1
17.11.3L.選擇素的適配體
17.11.4PDGF.BB 的適配體 ARC1
17.12治療用適配體的前景
參考文獻
第18章鏡像異構體的治療套用——進化篩選技術中手性原理的運用
Dirk Eulberg，Florian Jarosch，Stefan Vonhoff和Sven Klussmann 著；呂雪飛譯
18.1進化篩選技術
18.2手性
18.2.1自然中手性的發現和闡釋
18.2.2鏡像蛋白
18.2.3鏡像核酸
18.3鏡像進化技術：篩選.反射
18.3.1D.型肽適配體
18.3.2功能性的鏡像寡核苷酸：Spiegelmers
18.4小結
致謝
參考文獻
第19章臨床套用：抗VEGF適配體
Tony Realini，Eugene W.M.Ng和Anthony P.Adamis著；屈鋒，陳爾凝 譯
19.1引言
19.2VEGF選為靶標的理由
19.3VEGF與人類疾病
19.3.1癌症
19.3.2年齡相關的黃斑變性
19.3.3糖尿病性視網膜病變
19.4VEGF治療的兩難境地
19.4.1VEGF與人體生理
19.4.2克服兩難困境
19.5VEGF抑制劑
19.6進入Macugen
19.6.1臨床前研究
19.6.2Macugen的臨床試驗
19.7展望
參考文獻
後記我的個人觀點：15年後的適配體
Larry Gold著;屈鋒譯
開篇
個專利
NeXagen和NeXstar的創立
診斷成像
適配體治療藥物
SomaLogic公司基於適配體的診斷試劑
天然的適配體存在嗎？
總結——藥物開發的SELEX一課
致謝
參考文獻
