惰性多聚體可用來促進250個鹼基以上的探針的雜交率。對單鏈探針可增加3倍,而對雙鏈探針、隨機剪下或隨機引物標記的探針可增加高達100倍。而短探針不需用促進劑,因其複雜度低和分子量小,短探針本身的雜交率就高 。
基本介紹
- 中文名:核酸分子雜交促進劑
- 用於:較長雙鏈探針雜交
- 性質:多聚胺
- 意義:聚丙烯酸
硫酸葡聚糖是一種廣泛用於較長雙鏈探針雜交的促進劑。這是一種多聚胺,平均分子量為500000。另一種常見的促進劑是聚乙二醇(PEG),PEG分子量小(6000~8000)、粘度低、價格低廉,但它不能完成取代硫酸葡聚糖。在某些條件下5%~10%硫酸葡聚糖效果較好,若用5%~10%PEG則可產生很高的本底。因此,使用促進劑時有必要最佳化條件。另一種多聚體促進劑是聚丙烯酸,用其鈉鹽,濃度為2%~4%。與硫酸葡聚糖相比,其優點是價格低廉,粘度低(MW=90000)。
小分子化學試劑酚和硫氰酸胍也能促進雜交,它們可能是通過增加水的疏水性和降低雙鏈和單鏈DNA間的能量差異而發揮作用。酚作為雜交促進劑,只能在低DNA濃度的液相雜交中觀察到,該方法曾被稱為酚乳化復性技術,該法不能用於固相雜交,因酚可引起核酸與膜的非特異吸附作用,即使在液相雜交中的套用也是有限的。而硫氰酸胍可通過降低雙鏈DNA的Tm值而起作用。此外,該分子還可以促進RNA的雜交,有裂解細胞而抑制RNase的作用。總之,硫酸葡聚糖和聚乙二醇因能用於固相雜交是目前最常用的雜交促進劑。