《核受體參與UGT1基因簇內轉錄共調控的機理研究》是依託上海交通大學,由黃海燕擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:核受體參與UGT1基因簇內轉錄共調控的機理研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:黃海燕
- 依託單位:上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
UGT1基因簇編碼一類重要的Ⅱ相藥物代謝酶(UDP-葡萄糖醛酸轉移酶,UGT),由可變區和恆定區組成,任意一個可變外顯子都可被選擇性地剪接到下游的一套恆定外顯子上,而形成多種UGT轉錄本。核受體(NR)是動物體內最豐富的轉錄因子家族之一,也是目前最成功的藥物靶標之一,它們的配體幾乎都能被UGT轉化。申請者前期的研究發現很多NR成員顯著共調控UGT1簇多個基因的轉錄,表明UGT與NR兩大家族之間存在複雜的反饋調節網路,該網路對預測藥物相互作用和預防人類疾病具有重要意義。申請者還在UGT1基因簇中發現了兩個重要的增強子區可能介導NR對UGT1的共調控。本申請將採用染色質構象捕獲技術考察這兩個增強子區是否遠程調控UGT1基因簇內多個基因的轉錄,並找出各調節性NR在這兩個增強子區的順式作用元件。該研究將進一步詮釋人類UGT1基因多態性的生物學意義,並為臨床合理用藥提供理論依據。
結題摘要
尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉移酶是一種極為重要的藥物代謝酶,它在代謝各種內外源性有機脂類毒物上具有無可替代的重要功能,其突變會引起一些先天性疾病如黃疸病,所以研究該基因的表達調控具有十分重要的意義。本項目主要研究了一些可能的UGT1A的調控元件:4個潛在的增強子和兩個CTCF結合位點對於UGT1A基因表達調控以及空間構架的影響。 我們發現一些核受體對於UGT1A基因的上調作用,並使用EMSA實驗確定了核受體與其中兩個增強子結合;採用CRISPR/Cas9基因編輯技術分別敲除和反轉了這些增強子序列,並進一用qPCR、RNA-seq技術研究這些增強子與UGT1A基因表達調控的關係,發現其中2個增強子發揮重要功能;我們最後使用染色體構象捕獲技術研究了這些增強子以及CTCF結合位點與UGT1A基因空間構象的關係,發現這些調控元件和UGT1A基因構成了一個複雜的調控網路,無論在結構構架還是在功能調控上都具有相關聯繫。