校辦工廠管理是學校和校辦工廠有計畫、有組織地運用工廠資源，提高效益，使其為教學科研服務的活動。基本內容包括四個方面：（1）建立和健全管理機構， 形成合理的組織管理體系。（2）實行計畫管理。依據學校的發展規劃、教育工作的要求，制訂校辦工廠的發展規劃。科學地組織人力、物力、財力等各種資源，使校辦工廠所承擔的教學、科研、生產、維修等各項任務得以協調、均衡地完成。
（3）實行技術管理。基本內容是產品和工藝的設計、產品的質量、設備、技術人員的考核培訓、檔案資料、技術標準等各項工作的管理。在充分發揮學校技術力量的基礎上，在校辦工廠內建立教師、技術人員和工人相結合的隊伍，不斷開發新產品、新技術，加速科研成果轉變為生產力的進程。（4）財務和物資的管理。實行經濟核算，節約原料，降低成本，提高勞動生產率。接受學校財務部門的指導和監督，實行成本核算和財務結算。各種物資的採購、供銷、保管、使用和維修，建立相應的規章制度，避免浪費和不必要的消耗。1989年 1月國家教育委員會發布的《普通高等學校校辦工廠管理的規定》是學校工廠管理的依據。
