柴油的降凝機理也可以認為主要有：晶核作用理論、吸附理論、共晶理論或三者協同作用。
①晶核作用理論
降凝劑在高於析蠟溫度下結晶析出，它起著晶核作用而成為蠟晶發育的中心，使生物柴油中的小蠟晶增多，不易產生大的蠟團。
②吸附理論
降凝劑吸附在蠟晶周圍，阻止進一步析出的蠟晶結合，使其不與烴組分一起形成三維網狀凝膠結構，從而降低了生物柴油的凝點，達到改善流動性的目的。
③共晶理論
降凝劑分子有與石蠟分子相同的和不同的結構部分，相同的部分為烴鏈（非極性集團)，可與石蠟共晶，不同的部分(極性集團)則阻礙蠟晶進一步長大。
④晶核、吸附和共晶的協同作用
宋昭崢等人認為，降凝劑的上述3種降凝機理都可能存在。胡合貴等人還提出了抑制蠟晶中三維網狀結構生成的吸附一共晶理論，認為降凝劑的作用機理取決於降凝劑的種類。
