《染色體9q22.33區多態性與卵巢癌易感性關係及功能研究》是依託天津醫科大學，由李蓮擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：染色體9q22.33區多態性與卵巢癌易感性關係及功能研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：李蓮
- 依託單位：天津醫科大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
卵巢癌是複雜的多基因疾病，遺傳因素髮揮重要作用。本課題組牽頭在國內開展了中國漢族女性上皮源性卵巢癌GWAS研究並且已發表。我們發現了2個國人特有的卵巢癌易感位點，其中具有最顯著意義的是位於9q22.33區的rs1413299位點。該SNP位於COL15A1基因內含子6上，TGFBR1基因的上游105kb上。美國TCGA數據顯示COL15A1基因表達在卵巢癌腫瘤組織和癌旁正常組織間有差異，且TGFBR1表達高預後差。因此，本課題將採用三個階段進行，首先在第一階段採用精細掃描作圖後，進行連鎖關聯分析，找出此區域中與rs1413299有高連鎖的SNPs；然後，採用病例對照研究方法進行關聯分析，找出與卵巢癌易感性相關的SNPs；最後，利用計算機軟體預測篩選有調控意義的功能SNP位點，進行細胞學功能研究。本課題為闡明卵巢癌的發生機制、篩選易感人群、開展早期診斷及個體預防提供基礎，具有深遠的臨床意義。
結題摘要
卵巢癌是複雜的多基因疾病，遺傳因素髮揮重要作用。本課題組前期的中國漢族女性上皮源性卵巢癌GWAS研究中，發現了2個國人特有的卵巢癌易感位點，其中具有最顯著意義的是位於9q22.33區的rs1413299位點，我們對此區域進行重測序，篩選出此區域中與rs1413299有高連鎖的21個SNP位點；然後在1099例卵巢癌病例和1591例健康對照，使用Sequenom iPlex 和WaferGen平台進行了21個SNP位點的基因分型，通過統計分析篩選出5個與卵巢癌易感性相關的SNP位點；選取101例卵巢癌腫瘤組織，採用real-time 實時定量PCR 方法對SNPs 位點相關基因的mRNA 表達進行檢測。比較不同SNPs 基因型mRNA 表達的差異，發現2個SNP的基因型（rs7027650和rs1889268）跟Col15A1表達具有相關性。最後，通過功能預測軟體預測SNP功能，發現rs7027650可能是9q22.33區域的功能SNP，凝膠遷移滯後實驗發現了rs7027650的A基因型相較於T基因型有明顯的結合集合條帶。本研究為卵巢癌病因學研究以及探索新的生物標誌物提供可能的依據。
